Staatsanwalt Martin Wells wacht eines Morgens im Gefängnis auf, ohne zu wissen, weshalb. Die Agents Scully und Doggett, ein alter Freund von Martin, sollen seine Überführung in eine andere Anstalt begleiten. Doch dazu kommt es nicht, denn Wells wird auf offener Straße von seinem Schwiegervater erschossen. Trotzdem wacht er am nächsten Morgen erneut auf und steht nun wegen Mordes an seiner Frau vor dem Haftrichter. Entsetzt erkennt er, dass er sich rückwärts durch die Zeit bewegt.
Die Observierung einer Sekte in Pittsburgh endet in einer Katastrophe: 20 Sektenmitglieder und zwei FBI-Agenten werden ermordet aufgefunden. Direktor Skinner und Agent Doggett machen sich auf die Suche nach dem Anführer der Sekte, der eine rätselhafte Macht über die Träume seiner Anhänger und Gegner zu haben scheint.
Zach verpasst eine Veranstaltung seiner Tochter Jessie. Die kleine Nachwuchsforscherin hat indessen ganz andere Probleme: Ihre Schule wird von einer Horde bewaffneter Winzlinge angegriffen.
König Jared findet im Kampf gegen die Outrider drei weitere Verbündete. Oberbösewicht Nemesis erfährt von der Allianz und versucht mit seinen Phantomwesen die Herrscher in seine Gewalt zu bringen.
Die Terroristen sind verwundbar. Sie könnten aufhören zu existieren, wenn ihre Vorfahren im Jahr 2012 getötet werden. Ein Test soll Gewissheit bringen. Versuchspersonen: Kiera und ihre Großmutter.
Kagame beginnt mit Schritt eins seiner Agenda: die Intellektuellen und Dissidenten für sich zu gewinnen. Im Rennen gegen die Zeit müssen Kiera und Carlos einen entführten CEO befreien.
Catherine kann sich befreien und versucht, zwei Soldaten zu überzeugen, das Stargate zu passieren. Brücke und Professor Langford machen währenddessen Bekanntschaft mit einem unbekannten Wesen.
Captain Picard ist mit einem Team ins 19. Jahrhundert gereist, um die feindlichen Aliens aufzuspüren und Data zu retten. In einem Krankenhaus treffen sie auf zwei der Außerirdischen, die gerade einem Cholera-Kranken die Lebensenergie entziehen. Data sucht unterdessen selbst nach einem Weg zurück in seine Zeit. Hilfe erhält er dabei von unerwarteter Seite: In einer Dame der Gesellschaft erkennt er Guinan, die Barkeeperin der Enterprise, wieder.
Lt. Barclay fürchtet sich schrecklich vor dem Beamen. Ein Gespräch mit Troi überzeugt ihn, sich trotzdem an Bord eines verlassenen Forschungsschiffes beamen zu lassen. Bei seiner Rückkehr glaubt er, ein Monster zu sehen. Niemand schenkt ihm Glauben.
Die Enterprise unterstützt Botschafter Alkar bei seiner Friedensmission. Während er zwischen den feindlichen Parteien vermittelt, stirbt seine alte Mutter. Daraufhin beginnt Troi, sich äußerst merkwürdig zu verhalten. Sie altert in kürzester Zeit um Jahre.
Der Immobilienmakler Carlton Chase wird in einer Gefängniszelle von einem Unbekannten erschossen. Scully und Doggett sollen herausfinden, wie der Mann in einem hermetisch abgeschlossenen Raum ermordet werden konnte. Zunächst finden sie keine andere Erklärung als den "Röntgenblick" von Superman, den der Schütze gehabt haben muss, um durch einen kleinen Lüftungsschacht vom Dach des Gebäudes aus zu treffen. Aber dann führt eine Spur sie zu einem zwielichtigen Kammerjäger.
Am Abend der Beerdigung des Schrottplatzarbeiters Ray Pearce stirbt auch dessen Freund und Arbeitskollege bei einem merkwürdigen Autounfall. Scully und Doggett finden schnell heraus, dass der Mann ermordet wurde und alles auf seinen verstorbenen Kollegen Ray als Täter hindeutet. Dass Ray dazu von den Toten auferstanden sein müsste, ist nicht der einzige Haken bei der Geschichte: Der Täter müsste zudem die 4.300-fache Dichte von Stahl aufweisen.
Ein amerikanischer Geschäftsmann stirbt kurze Zeit nach seiner Ankunft in Washington. Scully stellt bei der Autopsie fest, dass er schon in Bombay, wo er ins Flugzeug stieg, tot gewesen sein muss. Doch wie soll ein Toter um die halbe Welt gereist sein? Scullys Theorie, dass der Körper als Unterschlupf für jemanden diente, der auf diese Weise illegal in die USA einreiste, hält Doggett allerdings für völlig abwegig. Doch wenig später kommt es zu zwei ähnlichen Fällen. Ein zwölfjähriger Junge bringt sie dann auf die richtige Spur.
In Pennsylvania besucht Doggett eine Familie, die ein Jahr zuvor schon der inzwischen verschwundene Mulder aufgesucht hatte. Der hatte im Fall einer verschwundenen Frau ermittelt. Die Familie und der örtliche Sheriff behaupten allerdings, Mulders damaliger Besuch sei auf Grund eines Missverständnisses erfolgt. Aber dann findet Doggett Hinweise, dass er belogen wird: Mulder muss ein zweites Mal dort gewesen sein.
Das Team besucht das ehemalige Waverly Hills Sanatorium in Louisville, Kentucky. Sie wollen vor Ort ein Video überprüfen, das angeblich einen Geist zeigt, der in der früheren Anstalt spukt. Anschließend überschreiten Bill, Devin und Jael die Grenze nach Mexiko und reisen nach Guadalajara. Dort überprüfen sie den Wahrheitsgehalt eines Films, der angeblich eine ganze Flotte vorbeifliegender UFOs zeigt. Dabei handelt es sich um eine der größten UFO-Sichtungen überhaupt.
Sheppard und seine Crew stehen nach einem Erforschungsflug plötzlich vor einem Problem: Irgendetwas hat die Kontrolle über alle elektronischen Systeme übernommen. Über eine plötzlich auf einem Bildschirm auftauchende Schrift beginnt jemand mit der Crew zu kommunizieren und gibt sich als Elizabeth Weir aus.
McKay wird von einem Parasiten befallen, der sich im Gehirn ausdehnt und operativ nicht zu entfernen ist. Diese Krankheit befällt ältere Menschen und ist in der Galaxie als "die zweite Kindheit" bekannt. Als sich Jeanie von McKay verabschiedet, berichtet Ronon von einer Heiligenstätte. Dort hat der Sterbende die Chance, noch einen Tag zu leben, um sich von Angehörigen zu verabschieden. Jeanie begibt sich trotz vieler Gefahren mit ihrem Bruder dorthin und kann das Rätsel um den Parasiten lösen.
O'Neill bekommt überraschenden Besuch: Joe Spencer, ein Friseur aus Indiana, taucht bei ihm auf und behauptet, in Visionen alle Abenteuer des SG-1-Teams hautnah mitzuerleben. Alle Freunde und Verwandte haben sich bereits von Joe abgewandt, weil sie ihn für verrückt halten. Nun hat er nichts mehr zu verlieren und bittet O'Neill um Hilfe. Carter findet heraus, dass Joe offenbar ein Antiker-Gen besitzt.
Im Kampf gegen die Goa'uld führen Teal'c und Bra'tac die Jaffa-Rebellion an. Doch Replikatoren stürmen das Rebellenschiff. Während Daniel weggebeamt wird, bringt sich die restliche Besatzung in Sicherheit. Um die desillusionierten Jaffa zu motivieren, entscheidet sich Teal'c, einen Tempel der Goa'uld anzugreifen. Carter macht sich Sorgen um Daniel und vermutet, dass dieser entführt wurde, da die Replikatoren Informationen über die ihnen gefährlichen Antikerwaffen erhalten wollen.
Dem SG-1-Team kommt zu Ohren, dass im Tempel von Dakara eine Waffe versteckt sein soll, die in der Lage ist, alles Leben in der Galaxis zu zerstören. Auch die Replikatoren sind an der Waffe interessiert. Carter will die Waffe vernichten, doch Selmak hat eine andere Idee. Sie will die Waffe so umbauen, dass sie nur die Replikatoren vernichtet, aber alle anderen Bewohner der Galaxie verschont.
O'Neill macht sich Sorgen um Daniel, den er noch immer in Gefangenschaft vermutet. Doch Daniel befindet sich lediglich auf einer anderen Existenzebene. Dort findet er heraus, dass Anubis plant, eine heilige Stadt anzugreifen. Teal'c und Bra'tac werden unterdessen von den Jaffa als Helden verehrt. Trotzdem grübelt Teal'c, ob er sein Leben weiterhin dem Kampf gegen die Goa'uld widmen soll.
Die Graystones suchen nach Zoe, während die rachsüchtige Clarice ihnen dicht auf den Fersen ist. Unterdessen will die STO Lacys Tod, da sie die Macht hat, die Zylonenarmee zu kontrollieren. Der Guatrau hat derweil herausgefunden, dass Joseph und Sam Adama Zylonen nach Tauron verschoben haben.
Daniel, Amanda und Zoe geben alles, um Clarices Plan zu vereiteln und Tausende von Leben zu retten, während sie von der GDD verfolgt werden, die sie als Terroristen betrachtet. Fidelia wendet sich unterdessen gegen ihren Vater und hilft damit Joseph und Sam Adama.
Nach jahrelanger Suche hat die Galactica endlich den sagenumwobenen Planeten Erde gefunden. Laut Wunderkind Dr. Zee würde eine Landung allerdings einen Angriff der Zylonen provozieren.
Commander Adama schickt Troy und Dillon in wichtiger Mission auf die Erde. Die zwei jungen Piloten sollen der Menschheit dabei helfen, sich im Falle eines Zylonen-Angriffs verteidigen zu können.
Troy, Dillon und Jamie reisen ins Jahr 1944. Dort will das Trio Commander Xaviar daran hindern, die Entwicklung der V2-Rakete zu unterstützen. Zurück in der Gegenwart wartet schon das nächste Problem.
Das Team folgt einem Einheimischen durch die Wüste in seine Siedlung. Währenddessen will Brücke einen Deal mit den Alien-Anführern aushandeln.
Sheppard und seine Crew stehen nach einem Erforschungsflug plötzlich vor einem Problem: Irgendetwas hat die Kontrolle über alle elektronischen Systeme übernommen. Über eine plötzlich auf einem Bildschirm auftauchende Schrift beginnt jemand mit der Crew zu kommunizieren und gibt sich als Elizabeth Weir aus.
McKay wird von einem Parasiten befallen, der sich im Gehirn ausdehnt und operativ nicht zu entfernen ist. Diese Krankheit befällt ältere Menschen und ist in der Galaxie als "die zweite Kindheit" bekannt. Als sich Jeanie von McKay verabschiedet, berichtet Ronon von einer Heiligenstätte. Dort hat der Sterbende die Chance, noch einen Tag zu leben, um sich von Angehörigen zu verabschieden. Jeanie begibt sich trotz vieler Gefahren mit ihrem Bruder dorthin und kann das Rätsel um den Parasiten lösen.
Ben, Lanisha und Devin fahren nach Tombstone, Arizona. Dort wollen sie im historischen Bird-Cage-Theater eine Videoaufnahme aus dem Jahr 2008 überprüfen, auf der angeblich in einem Spiegel das Bild eines Mannes in einem Sarg auftaucht. In der Zwischenzeit überprüft Bills Team mysteriöse Lichter, die über einer Autobahn in Los Angeles zu sehen sein sollen.
Der Immobilienmakler Carlton Chase wird in einer Gefängniszelle von einem Unbekannten erschossen. Scully und Doggett sollen herausfinden, wie der Mann in einem hermetisch abgeschlossenen Raum ermordet werden konnte. Zunächst finden sie keine andere Erklärung als den "Röntgenblick" von Superman, den der Schütze gehabt haben muss, um durch einen kleinen Lüftungsschacht vom Dach des Gebäudes aus zu treffen. Aber dann führt eine Spur sie zu einem zwielichtigen Kammerjäger.
Am Abend der Beerdigung des Schrottplatzarbeiters Ray Pearce stirbt auch dessen Freund und Arbeitskollege bei einem merkwürdigen Autounfall. Scully und Doggett finden schnell heraus, dass der Mann ermordet wurde und alles auf seinen verstorbenen Kollegen Ray als Täter hindeutet. Dass Ray dazu von den Toten auferstanden sein müsste, ist nicht der einzige Haken bei der Geschichte: Der Täter müsste zudem die 4.300-fache Dichte von Stahl aufweisen.
Ein amerikanischer Geschäftsmann stirbt kurze Zeit nach seiner Ankunft in Washington. Scully stellt bei der Autopsie fest, dass er schon in Bombay, wo er ins Flugzeug stieg, tot gewesen sein muss. Doch wie soll ein Toter um die halbe Welt gereist sein? Scullys Theorie, dass der Körper als Unterschlupf für jemanden diente, der auf diese Weise illegal in die USA einreiste, hält Doggett allerdings für völlig abwegig. Doch wenig später kommt es zu zwei ähnlichen Fällen. Ein zwölfjähriger Junge bringt sie dann auf die richtige Spur.