Die Crew entdeckt ein verlassenes Raumschiff, das von Reavern angegriffen wurde, und nimmt den einzigen Überlebenden an Bord. Kurz darauf befiehlt ein Raumkreuzer der Allianz der "Serenity" anzudocken. Die Crew wird verhört, und da die Allianz die Existenz der Reaver leugnet, klagt der Allianz-Commander Harken die Crew der "Serenity" wegen der Plünderung des Schiffes und der Ermordung der Passagiere an. Simon und River müssen sich unterdessen gut verstecken, um den Regierungsbeamten zu entgehen.
Aus dem Nachlass von Catherine Langford, die einst das Stargate entdeckte, erhält Daniel ein Buch. In ihm findet er den Hinweis auf ein Zero-Point-Modul, das sich offenbar im alten Ägypten im Besitz des Goa'uld Ra befand. Daniel überredet daraufhin O'Neill zu einer Zeitreise, um sich dieses wichtige Stück Antikertechnologie zu sichern. Eine heikle Mission, denn die Zeitlinie darf während der Reise nicht beeinflusst werden, damit das Team wohlbehalten zurückkehren kann.
Die Vergangenheit wurde durch die Zeitreise des SG-1-Teams verändert. Alternative Ichs der Mitglieder reisen nach Chulak, wo sie auf Teal'c treffen. Weil dieser sie nicht erkennt, lässt er sie gefangen nehmen. Doch O'Neill kann ihn schließlich überzeugen. Den Goa'uld gelingt es unterdessen, einen der ihren in Daniel zu implantieren.
Lieutenant Colonel Mitchell stößt als neues Mitglied zum SG-1-Team. Doch ihn erwartet zunächst eine bittere Überraschung: Von General Landry erfährt er, dass sich das Team aufgelöst hat. Carter befindet sich in der Area 51, Daniel steht kurz vor seiner Abreise nach Atlantis und Teal'c hat die Mannschaft verlassen, um bei seinem Volk zu leben. Als allerdings Vala mit einer Schatzkarte zurückkehrt, beschließt Mitchell, das SG-1-Team wieder zu vereinen.
Nachdem Vala mit einer Schatzkarte zurückgekehrt ist, beschließt Mitchell, das aufgelöste Team von SG-1 wieder zu vereinen, um gemeinsam nach dem Schatz zu suchen. Auf ihrer Suche widerfährt Daniel und Vala Seltsames: Sie werden anscheinend in die Körper zweier fremder Personen befördert und befinden sich auf einem Planeten in einer fernen Galaxie. Die Bewohner dort verehren einen ausgesprochen sonderbaren Anführer.
Anakin und Obi-Wan begleiten Satine von Mandalore auf der Coronet nach Coruscant. Dort soll die schöne Herzogin eine Aussage vor dem Senat machen. Als während der Reise an Bord geschmuggelte Spinnendrohnen die Besatzung angreifen, müssen die Jedis die Gefahr bekämpfen, aber auch herausfinden, wer hinter dem Anschlag steckt.
Weil Satine von Mandalore die Aufrüstungspläne der "Death Watch" durchkreuzt, befiehlt Vizsla ihren Tod. Als der von ihm angeheuerte Attentäter jedoch sein Ziel verfehlt, wird die Herzogin ihrerseits beschuldigt, einen Anschlag verübt zu haben und muss fliehen. Vorher wurde ihr jedoch ein Datenchip zugesteckt, der lebenswichtige Informationen erhält, an denen der Senat sehr interessiert ist.
Während ihres Flugs nach Azati Prime stößt die Enterprise auf einen Planeten mit einem abgestürztem Raumschiff der Xindi. Da keine Lebenszeichen zu empfangen sind, begibt sich Archer mit einem Teil der Crew ins Innere des Xindi-Schiffs und findet dort eine Art Brutstätte. Um die unschuldigen Leben zu retten, will Archer die Brutstätte reparieren. Doch dafür müsste er die Antimaterie einsetzen, die eigentlich für die Konfrontation bei Azati Prime vorgesehen ist.
Der extrem schüchterne Reginald Barclay, Ingenieur auf der Enterprise, flüchtet sich in simulierte Abenteuer auf dem Holodeck. Dort lebt er seine Fantasien aus. Als der Warp-Antrieb der Enterprise außer Kontrolle gerät, liegt plötzlich die Rettung des Schiffes in seiner Hand: Auf dem Holodeck will er die Ursache für die Fehlfunktionen herausfinden.
Die Voyager-Crew findet einen Weg, Spezies 8472 zu bekämpfen. Captain Janeway will den Borg dieses Wissen zugänglich machen. Unter einer Bedingung: freies Geleit durch ihr Territorium. Für die Verhandlungen kommt die Borg-Drohne "Seven of Nine" an Bord der Voyager.
Ein Angriff aus dem Hinterhalt hat zur Folge, dass Dutch (Hanna John-Kamen) und Johnny die Hilfe von Pree mit seinen Erfahrungen als ehemaliger Warlord suchen. Unterdessen versucht D'avin , einem schwarzen Haftbefehl auf den Grund zu gehen, der ganz unerwartet persönlich wird.
Die Crew entdeckt ein verlassenes Raumschiff, das von Reavern angegriffen wurde, und nimmt den einzigen Überlebenden an Bord. Kurz darauf befiehlt ein Raumkreuzer der Allianz der "Serenity" anzudocken. Die Crew wird verhört, und da die Allianz die Existenz der Reaver leugnet, klagt der Allianz-Commander Harken die Crew der "Serenity" wegen der Plünderung des Schiffes und der Ermordung der Passagiere an. Simon und River müssen sich unterdessen gut verstecken, um den Regierungsbeamten zu entgehen.
Alle außerirdischen Mitglieder des Stargate-Programms müssen sich zu Befragungen durch die IOA auf der Erde einfinden. Sam Carter ist beunruhigt: Sie befürchtet, dass Ronon wegen seines aufbrausenden Temperaments Probleme bekommen könnte, und bittet deshalb ihren alten Freund Teal'c, ihn auf das Interview vorzubereiten. Gemeinsam reisen die beiden zur Erde. Als sie auf halbem Weg auf der Midway-Station eintreffen, tauchen plötzlich die Wraith auf.
Bo erfährt, dass ihre Mutter Eva in einem Fae-Gefängnis sitzt, seit sie Trick angegriffen hat. Bo macht sich auf den Weg, Eva zu befreien, doch Hades kommt ihr zuvor. Derweil ist Tamsin der festen Überzeugung, dass sie bald sterben wird. Dann sie findet heraus, dass sie schwanger ist.
Der Milliardär und Ex-Waffenfabrikant Tony Stark hat öffentlich gemacht, dass er hinter der Iron Man-Maske steckt. Bald jedoch bereut er den Schritt schon, denn das US-Militär setzt alles daran, in den Besitz der Waffentechnologie zu kommen, die in dem Superhelden-Anzug steckt. Doch das ist nicht Starks einziges Problem: Superheld Iron Man kriegt es mit dem Super-Bösewicht Ivan Vanko zu tun. Außerdem scheint es, als würde Stark langsam von dem Minireaktor in seiner Brust vergiftet werden.
In Los Angeles wird die Familie Mason, Matt , Johanna und ihre drei Kinder, voneinander getrennt, während die Welt von einer Reihe von Naturkatastrophen erschüttert wird: dem Ausbruch eines Supervulkans, einem riesigen Erdbeben und einem massiven Tornado. Die Masons müssen sich auf ihre Fähigkeiten und ihre Intelligenz verlassen, um einander wiederzufinden und zu überleben.
Bo erfährt, dass ihre Mutter Eva in einem Fae-Gefängnis sitzt, seit sie Trick angegriffen hat. Bo macht sich auf den Weg, Eva zu befreien, doch Hades kommt ihr zuvor. Derweil ist Tamsin der festen Überzeugung, dass sie bald sterben wird. Dann sie findet heraus, dass sie schwanger ist.
Aus dem Nachlass von Catherine Langford, die einst das Stargate entdeckte, erhält Daniel ein Buch. In ihm findet er den Hinweis auf ein Zero-Point-Modul, das sich offenbar im alten Ägypten im Besitz des Goa'uld Ra befand. Daniel überredet daraufhin O'Neill zu einer Zeitreise, um sich dieses wichtige Stück Antikertechnologie zu sichern. Eine heikle Mission, denn die Zeitlinie darf während der Reise nicht beeinflusst werden, damit das Team wohlbehalten zurückkehren kann.
Die Vergangenheit wurde durch die Zeitreise des SG-1-Teams verändert. Alternative Ichs der Mitglieder reisen nach Chulak, wo sie auf Teal'c treffen. Weil dieser sie nicht erkennt, lässt er sie gefangen nehmen. Doch O'Neill kann ihn schließlich überzeugen. Den Goa'uld gelingt es unterdessen, einen der ihren in Daniel zu implantieren.
Lieutenant Colonel Mitchell stößt als neues Mitglied zum SG-1-Team. Doch ihn erwartet zunächst eine bittere Überraschung: Von General Landry erfährt er, dass sich das Team aufgelöst hat. Carter befindet sich in der Area 51, Daniel steht kurz vor seiner Abreise nach Atlantis und Teal'c hat die Mannschaft verlassen, um bei seinem Volk zu leben. Als allerdings Vala mit einer Schatzkarte zurückkehrt, beschließt Mitchell, das SG-1-Team wieder zu vereinen.
Nachdem Vala mit einer Schatzkarte zurückgekehrt ist, beschließt Mitchell, das aufgelöste Team von SG-1 wieder zu vereinen, um gemeinsam nach dem Schatz zu suchen. Auf ihrer Suche widerfährt Daniel und Vala Seltsames: Sie werden anscheinend in die Körper zweier fremder Personen befördert und befinden sich auf einem Planeten in einer fernen Galaxie. Die Bewohner dort verehren einen ausgesprochen sonderbaren Anführer.
Lucy kämpft um Murphys Leben. Währenddessen bekämpfen Warren und die anderen einen biologisch modifizierten "Frankenzombie", der einen Hinweis zu Warrens Traum bewacht.
Immer noch komplett durch den Wind, nachdem ein Teammitglied das Zeitliche gesegnet hat, dreht Murphy plötzlich durch. Warren gelingt es nicht, Murphy und die anderen aufzuhalten, einen schrecklichen Racheakt zu begehen.