Nachdem die Menschen angefangen haben fremde Planeten zu besiedeln, bricht ein intergalaktischer Bürgerkrieg aus. In der United States Space Command Militärakademie werden die Kadetten für den Krieg gegen einen scheinbar unüberwindbaren Feind ausgebildet. Kadett Thomas Lasky wird jedoch von Zweifeln an seinen Fähigkeiten geplagt. Als die Akademie Ziel eines außerirdischen Angriffs wird, ist es an Lasky und einem unbekannten "Supersoldaten", das Überleben der Menschheit zu sichern.
Der Polizist Nick Walker , der kurz zuvor mit einem Kollegen einen Goldschatz unterschlage hatte, wurde bei einem Einsatz getötet. Im Jenseits sitzt er überraschenderweise wieder in seinem Büro. Er gehört der Rest-in-Peace-Einheit an, die verbrecherische und zwielichtige Dämonen zur Strecke bringt. Sein Partner ist der erfahrene, doch nicht unbedingt sympathische Roy Pulsipher . In Gestalt eines schrulligen Chinesen und einer blonden Sexbombe machen die beiden Jagd auf den Mörder von Nick.
Warren führt einen Angriff auf Murphytown an, mit dem Ziel, den arroganten, selbsternannten Führer Murphy unschädlich zu machen. Schon bald stehen sich Warrens menschliche Armee und Murphys Zombie-Truppen in einem Kampf gegenüber, der entscheidend für das Schicksal der Menschheit sein könnte.
The Man kämpft mit allem, was er hat, gegen Addy . Dabei geht es um das Schicksal der schnell alternden Lucy , jener Mischung aus Mensch und Zombie, die womöglich den Schlüssel zur Rettung der Menschheit in sich trägt.
Der Tag der Wahrheit ist da, und die vorher noch zerstrittene Gang vereint sich noch einmal, um in der entscheidenden Schlacht Murphys Tochter Lucy zu retten und mit ihrer Hilfe das Zombie-Virus endgültig zu vernichten.
Dr. Parnassus ist nicht nur Besitzer eines Puppentheaters, er besitzt auch die Gabe, die Besucher des Theaters in eine Fantasiewelt zu entführen. Doch die Gunst des Doktors ist mit Vorsicht zu genießen. Parnassus ging mit dem Teufel einen Pakt ein, um ewig jung zu bleiben. Und das zu einem hohen Preis: Er versprach dem Teufel sein erstes Kind, sobald dieses 16 Jahre alt wird. Doch als der 16. Geburtstag seiner Tochter Valentina immer näher rückt, geht Parnassus eine weiter folgenschwere Wette mit dem Teufel ein, um sie zu retten.
Seit der ersten Mission durch das Stargate ist über ein Jahr vergangen. Unerwartet dringen außerirdische Gestalten durch das Tor ein, morden und entführen einen weiblichen Offizier. Colonel Jack O'Neill leitet eine Aufklärungsmission nach Abydos um herauszufinden wer die Angreifer waren. Daniel Jackson, der nach dem ersten Besuch auf Abydos geblieben war, hat inzwischen herausgefunden, dass es unzählige Sternentore gibt, die überall in der Galaxis verteilt sind. Er schließt sich dem Team an, das mithilfe des Jaffa Teal'c mehrere Gefangene aus den Händen des Schlangengottes Apophis befreit.
Der Alien Teal'c darf vorerst nicht, wie von O'Neill vorgeschlagen, Mitglied im SG-1- Team werden, sondern wird von der Regierung genau überprüft. Unterdessen klagt Kawalski über starke Kopfschmerzen. In der Krankenstation findet man unter seiner Haut, eine Goa'Uld-Larve, die sich in Richtung Kopf bewegt. Kawalski tötet daraufhin den diensthabenden Arzt. Es scheint, dass der Parasit Besitz von seinem Körper genommen hat. Unter Anleitung von Teal'C gelingt es den Ärzten, die Larve operativ zu entfernen. Jedoch übernehmen die Reste des Goa'uld nach der Operation erneut Kontrolle über ihn.
Auf dem Planeten Simarka finden Samantha Carter, Daniel Jackson und Jack O'Neill eine Kultur vor, die sehr an das Leben der Mongolen vor über hundert Jahren erinnert. Das Volk der Shavadai ist von einer strengen Klassengesellschaft geprägt, in der Frauen nur eine untergeordnete Rolle spielen. Samantha Carter wird gekidnappt und von Turghan, einem mächtigen Herrscher, versklavt. Als das SG-1-Team von dem Kidnapping erfährt, setzen sie alles daran, um ihre Kollegin zu befreien. Samantha Carter kann sich jedoch nur durch ein Duell wieder "frei" kämpfen.
Das SG1-Team landet auf dem Planeten P3X97 auf dem es zwei unterschiedliche Arten von Bewohnern gibt. Im Gegensatz zu den kultivierten Bewohnern der hellen Seite des Planeten, benehmen sich die Bewohner der dunklen Seite brutal und rücksichtslos. Nach dem das SG-1-Team von dem fremden Planeten zurückkehrt, weisen einzelne Mitglieder unnatürliche Verhaltensweisen auf und gleichen den brutalen Bewohnern der dunklen Seite. Nur Teal'C und Daniel bleiben von den Mutationen verschont und müssen auf den Planeten P3X97 zurückkehren, um ein Heilmittel für die Infizierten zu finden.
Die Menschheit muss die Erde gegen eine UFO-Invasion verteidigen, die die Zerstörung des Planeten zum Ziel hat. Während die entscheidende Schlacht tobt, schaffen es einige Astronauten, an Bord des Alien-Mutterschiffs zu gelangen. Dort finden sie ein Portal, das in die Heimatwelt der Aliens führt. Bevor sie getötet werden, gelingt es den Männern, diese Information weiterzugeben. Eine Eliteeinheit macht sich auf den Weg durch das Portal, in der verzweifelten Hoffnung, so die Erde retten zu können.