Monk untersucht einen Mordfall in einem Museum und lernt dabei eine sympathische ältere Dame kennen. Aber ihr Interesse an seiner Person macht den schrulligen Privatdetektiv stutzig.
Monk hat Freikarten bekommen und geht mit Stottlemeyer zu den Football-Playoffs. Als es vor dem Stadion zu einer Explosion kommt, glaubt Stottlemeyer an einen Unfall. Monk ist aber misstrauisch und geht der Sache auf den Grund.
Ein Erzfeind aus Jugendzeiten gibt Monk einen Auftrag: Er zweifelt an der Treue seiner Frau und Monk soll sie beschatten. Doch dann geschieht auch noch ein Mord - mit Brody als Verdächtigem.
Das Team steht vor einem Rätsel: Ein Navy-Offizier wurde auf exakt die gleiche Art getötet wie seine Eltern zehn Jahr zuvor. Zudem wollen die Kollegen ein paar Dinge für einen guten Zweck spenden, doch das gelingt nicht allen auf Anhieb.
In einem See wird die Leiche eines sehr geschätzten Navy-Technikers gefunden. Bei den Nachforschungen finden die Ermittler heraus, dass der Mann wohl ein Hacker war. Zudem bittet Faith ihre biologische Mutter Sloane um einen Gefallen.
Jimmy und Kasie sind gerade in einem Diner, als sie dort zusammen mit den anderen Gästen als Geiseln genommen werden. Eigentlich wollten die Täter in einem nahegelegenen Juweliergeschäft einen Diebstahl durchführen, doch der Coup misslang.
Die Ermittler versuchen, die wahre Identität eines Mannes zu klären, der behauptet, er habe während der Angriffe auf Pearl Harbor auf der U.S.S. Arizona gedient. Der alte Mann wünscht sich, nach seinem Tod dort bestattet zu werden.
Als eine Leiche spurlos verschwindet, geraten die NCIS-Ermittler auf die Spur eines Drogenrings, der auch Fornells Tochter Emily beliefert hat.
Im NCIS-Hauptquartier wird eine Leiche gefunden, die scheinbar mit einem alten Fall von Gibbs in Verbindung steht.
Ein Fall führt das Team zu einer jahrelangen Schatzsuche, während Gibbs und Fornell weiter heimlich gegen den Drogenring ermitteln.
Ein Mordfall führt das Team auf die Bahamas, wo McGee und Delilah gerade Urlaub machen. Gibbs Freund Clarence soll die beiden im Auge behalten.
Die Ermittlungen von Gibbs und Fornell gegen den Drogenring, den sie für Emilys Überdosis verantwortlich machen, stehen kurz vor dem Abschluss.
Torres und Bishop werden auf der Suche nach einem Sprengstofflager von ihrem Team abgeschnitten.
Charlie hat einen Termin bei seiner Versicherungsmaklerin, doch als er dort ist und seine Verträge unterschreiben will, stürmt ein maskierter Mann das Gebäude und schießt wild um sich.
In einem Park wird ein Anwalt von einem maskierten Mann, der aussieht wie der TV Superheld "Der Wächter der Nacht", erstochen. Charlie und seine Kollegen stehen vor einem Rätsel. Sie vermuten, dass es jemand auf den Anwalt abgesehen hat, der Selbstjustiz betreiben wollte, doch dann kommt alles anders als gedacht.
Charlie und Rex untersuchen den Mord eines wohlhabenden Mannes, der seinen Freunden, die sich kurz vor seinem Tod total zerstritten haben, anstatt seines Vermögens, "nur" seine drei Hunde hinterlässt. Unter Verdacht gerät auch der Hundesitter und die Anwältin, die das Testament des Toten aufgenommen hat.
Jane und Maura müssen eine alte Geistergeschichte aufklären, um ihren neuesten Fall abschließen zu können: ein Doppelmord in einem Krankenhaus. Angela überzeugt indes Frankie davon, Kent nicht länger aus dem Weg zu gehen und dessen Einladung zu einem Konzert anzunehmen. Maura erhält zudem Ratschläge einer Autorin, die ihr dabei helfen könnte, sich in der Literaturszene zu etablieren.
Ein Fahrradfahrer scheint spontan in Flammen aufgegangen zu sein. Schon bald kann Maura nachweisen, dass dieser bizarre Tod kein unerklärliches Rätsel ist, sondern die Tat eines wissenschaftlich bewanderten Mörders. Jane wird derweil eingeladen, in Quantico eine Klasse von FBI-Rekruten zu unterrichten und Angela ist auf der Suche nach einer eigenen Wohnung.
Als die mögliche Zeugin eines Doppelmordes verhaftet wird, geht Jane freiwillig als verdeckte Ermittlerin in das Gefängnis, um von der Frau wertvolle Informationen zu erhalten. Der Rest ihres Teams soll indes durch Janes Ermittlungen den Mörder dingfest machen. Nachdem der Fall gelöst ist, informiert sich Jane über den möglichen Job, der ihr in Quantico angeboten wurde.
Am Morgen, an dem Jane in einem Gerichtsprozess aussagen soll, entdeckt sie, dass ein wichtiges Beweisstück gestohlen wurde. Nun hat die Polizei von Boston genau drei Tage Zeit, das Verbrechen lückenlos aufzuklären - andernfalls wird der Mörder aus Mangel an Beweisen freigesprochen. Als Frankie entdeckt, dass Nina von Zauberei begeistert ist, will er unbedingt ein paar Tricks lernen.
Als in einem Park ein Finanzsachverständiger erschossen wird, kommen Jane und Maura einem ausgeklügelten Schneeballsystem auf die Spur. Zudem wird bei den Ermittlungen bekannt, dass Maura einst mit dem Hauptverdächtigen verheiratet war. Angelas Exfreund Ron taucht auf und erklärt, dass er sie immer noch liebt und Jane trifft eine Entscheidung, die ihr Leben für immer verändern wird.
Als ein Leichenbestatter in einem seiner eigenen Särge entdeckt wird, geraten Jane und ihre Kollegen tief in die Welt der Einbalsamierungen, Beerdigungen und Serienmörder. Tommy Rizzoli kommt mit seinem Sohn TJ nach Boston zu Besuch und spielt mit dem Gedanken, für immer nach Hause zurückzukehren. Jane verkündet, dass sie für das FBI arbeiten möchte.
Korsak ermittelt im Mordfall eines Vaters und einer Tochter, zwischen deren Mordfällen vierzig Jahre liegen. Besonders schwierig für ihn ist, dass er sowohl Vater als auch Tochter gut kannte. Da ihm der Fall persönlich zu nahe geht, beschließt er, dass nun der richtige Moment gekommen ist, um in den Ruhestand zu gehen. Jane will indes den Umzug ohne Mauras und Angelas Hilfe bewältigen.
Der letzte Fall für das Ermittlerteam: Ein Mann wird - mit Handschellen gefesselt - tot in seinem Bett aufgefunden. Korsaks Ruhestand ist indes in greifbare Nähe gerückt. Dank der Urlaubstage kann er einen Monat früher in Rente gehen. Jane kündigt an, dass auch sie sich eine kurze Auszeit nehmen wird und gemeinsam mit ihrer besten Freundin Maura Urlaub in Paris macht, bevor sie zum FBI wechselt.
Detective Jane Rizzoli und die Gerichtsmedizinerin Dr. Maura Isles ermitteln im Mordfall an einem wohlhabenden Pärchen. Alle am Tatort gefundenen Hinweise deuten auf den Serienkiller Charles Hoyt hin, der den Spitznamen "der Chirurg" trägt, da er beim Töten stets ein Skalpell verwendet. Doch Hoyt sitzt seit geraumer Zeit im Gefängnis. Hat er etwa einen Nachahmer?
Als kurz nacheinander zwei Frauen tot aufgefunden werden, denen ein Seidenschal um den Hals gebunden wurde, stellen sich die Ermittlerinnen Rizzoli und Isles eine schreckliche Frage: Ist der "Würger von Boston" in die Stadt zurückgekehrt, der vor 40 Jahre dreizehn Frauen erdrosselte? Als das Team in dieser Richtung ermitteln möchte, legt ihnen ihr neuer Vorgesetzter bald erste Steine in den Weg.
Der charmante Betrüger Neal Caffrey flieht kurz vor Ende seiner Haftstrafe aus dem Gefängnis, wird aber von FBI-Agent Peter Burke schnell wieder gefasst. Im Austausch für seine Freiheit hilft er dem FBI dabei, Wirtschaftsverbrechen aufzuklären.
Als Beweise in einem für eine Modeschau gedachten Kleid auftauchen, müssen Peter und Neal einen Verbrecher stoppen.
Drei Obdachlose bitten Monk, den Tod eines Freundes aufzuklären. Die Ermittlungen führen Monk zu einem Kloster mit einer Quelle, die wundersame Kräfte verspricht.
Aus dem Gefängnis ist ein gefährlicher Verbrecher entkommen, der auf seiner Flucht eine Frau umgebracht hat. Unterschlupf sucht der Gejagte ausgerechnet in Monks Wohnung. Außerdem behauptet der Sträfling, dass er Monks Halbbruder sei.
Natalie hilft einem gestürzten Radfahrer und wird dadurch unfreiwilligerweise zur Komplizin eines Fahrraddiebes, da der Mann sich gerade mit seinem Diebesgut auf der Flucht befunden hatte.
Die Kollegen feiern bei Kove zuhause Weihnachten, als sie angegriffen werden: Der Böse Weihnachtsmann aus Alaska hat es auf die Stadt abgesehen!
Ein Terrorist hat in einem Bus in San Diego eine Bombe versteckt, die detonieren soll, sobald sich das Fahrzeug in Bewegung setzt. Trent und seine Kollegen aus der kalifornischen Spezialeinheit müssen schnell handeln und mit allen Mitteln verhindern, dass der Bus losfährt!
Das NTSF-Team ermittelt in einem Fall explosiver Drinks, die an die Studenten der University of South San Diego verkauft werden.
Der junge Todd wurde in seiner Kindheit von seinem brutalen und alkoholabhängigen Vater geschlagen. Inzwischen ist aus Todd selbst ein verbitterter Jugendlicher geworden, der von seiner verzweifelten Mutter zu seinen Großeltern nach Walnut Grove geschickt wird, weil sie selbst nicht mehr weiter weiß. Charles bietet an, Todd zu helfen, indem er ihn bei sich auf der Farm arbeiten lässt.