Ein Eishockeyspieler, der Rache für die Taten seines Vaters üben will, hat den Tod seiner Mutter zu verarbeiten.
Ausgerechnet an einem Samstag wird San Diego von einem Terroristen bedroht. Nun liegt es in den Händen des Polizisten und Kommunikationsexperten Sam Stern, die Stadt zu retten.
Ein brutaler Serienkiller treibt sein Unwesen in San Diego. Der Mörder hat es anscheinend ausschließlich auf die Regisseure von Teenie-Filmen abgesehen. Natürlich übernehmen die Agenten Trent Hauser und Alphonse die Ermittlungen. Ihre Chefin Kove beginnt indes mit einem Podcast.
Was für eine spannende Begegnung: San Diegos Spezialeinheit schließt sich mit einer Gruppe Zeitreisender zusammen, um Verbrechen zu verhindern, die noch nicht geschehen sind, aber in der Zukunft begangen werden sollen.
Jessica wird von dem befreundeten Autor Nick Cullhane gebeten, seinen neuen Kriminalroman zu rezensieren. Kurz darauf wird das Manuskript gestohlen...
François Duval, ein russisch-kanadischer Doppelagent, der verdeckt eine Ballettschule leitete, wurde durch ein dubioses Gift getötet. Zuerst ist unklar, dass François ein Geheimagent war, doch als Charlie das mithilfe seines Teams herausgefunden hat, überschlagen sich die Ereignisse und sogar auf Charlie wird ein Giftanschlag verübt.
Im Deer Lake Gefängnis wird David, ein Häftling, mit einem Messer ermordet. Um herauszufinden, was genau passiert ist, lässt sich Charlie dort als Gefangener einschleusen. Anfangs läuft alles nach Plan, doch dann taucht ein Häftling auf, der von Charlie hinter Gitter gebracht wurde. Er droht Charlies Identität auffliegen zu lassen. Die Lage für Charlie wird immer gefährlicher.
Charlies Vater Edward ist Commander bei der Navy und mit seinem Schiff zu Besuch im Hafen von St. John's. Das Verhältnis der beiden ist ohnehin schon angespannt, doch als eine Polizistin in der Umgebung einer örtlichen Partymeile ermordet wird und einige Matrosen damit in Zusammenhang zu stehen scheinen, verhärten sich die Fronten zusehends.
Sara Carter bittet Gibbs, den Mord an ihrer Mutter nochmals zu untersuchen, da sie davon überzeugt ist, dass die Polizei den falschen Mann verhaftet hat. Abby erhält zudem eine Einladung zum Abendessen in einem brandneuen Sternelokal.
Das Team erfährt, dass einer von Ihnen auf der Abschussliste eines Todesschützen steht. Fieberhaft durchsuchen die Ermittler alte Fallakten, um herauszufinden, wer an ihnen Rache üben will.
Gibbs besucht die Gedächtnis-Andacht für einen Freund, der auf See gestorben ist. Dabei entdeckt er, dass sich der angeblich verstorbene Navy Captain Brooks versteckt hat, nachdem dessen Boot auf See angegriffen wurde.
Sloane ist davon überzeugt, dass ein Mann, der sie in Afghanistan gefangen gehalten und gefoltert hat, und der angeblich nach ihrer Rettung getötet wurde, in Washington D.C. ist. Vance und Gibbs fürchten, dass Sloane den Mann töten wird.
Einen Monat, nachdem Director Vance entführt wurde, ist sein Verbleib noch immer ungeklärt. Während das gesamte Team nicht nur im Land, sondern auch weltweit nach ihm sucht, übernimmt Gibbs interimsweise Vance' Posten als Leiter des NCIS.
Das NCIS-Team ermittelt, nachdem ein Navy-Lieutenant tot in seinem Whirlpool gefunden wurde. Torres scheint etwas neben der Spur zu sein und will mit den Jungs einen trinken gehen, doch der Abend endet in einer Katastrophe.
McGee ist ein großer Fan von Sheba Nicholas, einer bekannten Reality-TV-Schauspielerin. Als er erfährt, dass sie und ihr Mann fast Opfer eines Anschlags wurden und das NCIS in dem Fall ermittelt, ist er schrecklich nervös.
Gibbs ruhiger Urlaub in einer Hütte in den Wäldern wird gestört, als plötzlich Tobias Fornell und Navy Captain Brooks dort auftauchen. Auch das NCIS bittet ihn um Hilfe, denn in der Nähe versteckt sich ein Räuber auf der Flucht.
Als eine 50 Jahre alte Aufnahme auftaucht, die ein Mordopfer hinterlassen hat, versucht das NCIS-Team, Ray Jennings zu entlasten, der für das Verbrechen im Gefängnis sitzt. Hat sich die Geschichte damals ganz anders zugetragen?
Halloween steht vor der Tür und das Team muss sich um die Aufklärung neuer Mordfälle kümmern. Jimmy glaubt zudem, dass es in seinem Labor spuken könnte, nachdem sich dort auf mysteriöse Art und Weise Objekte bewegen.
Eine Frau kommt blutüberströmt mit einer Waffe in der Hand auf das Revier. Den überraschten Beamten erklärt sie, dass sie jemanden getötet hat. Durch das erlittene Trauma weiß die Frau allerdings nicht mehr, wer sie ist, noch wen sie getötet hat. Die Beamten versuchen, diesen eigenartigen Fall aufzuklären, während sie mit dem Verlust ihres Freundes und Kollegen Frost zurechtkommen müssen.
Ein Mörder hat sich einen perfiden Plan zurechtgelegt, um passende Opfer für seine grausamen Taten zu finden. Mittels Online-Anzeigen sucht er nach Menschen, die nicht vermisst werden, wenn sie verschwinden. Jane erfährt indes, dass es ein schwieriges Unterfangen wird, ihre Schwangerschaft vor ihrer Mutter und Maura geheim zu halten.
Die Beamten stehen erneut vor einem schwierigen Fall: Ein Mann wurde in seinem Katastrophen-Bunker getötet, der eigentlich als uneinnehmbar gilt. Nun will die Polizei herausfinden, wie und warum er zum Opfer wurde. Jane fällt es sehr schwer, sich auf den Fall zu konzentrieren, als sie erfährt, dass Korsak mit dem Gedanken spielt, in Pension zu gehen.
Die Beamten untersuchen den Mord an einer wohlhabenden Frau, die Krebs im Endstadium hatte und sowieso nur noch wenige Monate zu leben gehabt hätte. Maura unterrichtet indes an der Universität und trifft dabei auf einen Professor, der das Potenzial hätte, ihr Mr. Perfect zu sein. Da sie mit den Männern in ihrem Leben jedoch meist Pech hatte, ist sie unsicher, ob sie sich auf ihn einlassen soll.
Jane steht vor einem riesigen Problem. Es scheint fast so, als wäre einem Mörder das perfekte Verbrechen gelungen. Und zu allem Überfluss kann sie dieses Mal nicht auf Mauras Hilfe im Labor und in der Pathologie zählen, denn Maura ist auf einer Konferenz für Gerichtsmediziner. Korsak erhält indes Besuch vom Enkelsohn eines verstorbenen Freundes, mit dem er früher Musik gemacht hat.
Der Mord an einem Buchhändler führt Jane und Maura in die Welt keltischer Schriften und verschlüsselter Geständnisse. Auch Paddy Doyle scheint in die Geschichte verstrickt zu sein. Zudem versucht Maura, ihre beste Freundin Jane darauf vorzubereiten, den neuen Mann an ihrer Seite kennenzulernen. Janes Mutter will indes nochmals durchstarten und kündigt ihren Job im Café des Polizeireviers.
In einem Wettlauf gegen die Zeit müssen die Beamten versuchen, eine junge Zeugin zu finden, die beobachtet hat, wie eine Frau vor einem Nachtklub von einem Auftragskiller getötet wurde. Um das Mädchen zu retten, begibt sich Jane schließlich in größte Gefahr. Korsak beschließt, das Team mit der jungen Polizistin Nina Holiday zu ergänzen, nachdem Berry Frosts Schreibtisch lange leer stand.
In einem Weinkeller werden die mumifizierten Überreste einer Frau gefunden, die wohl vergiftet wurde. Dieser Fall ist eine harte Bewährungsprobe für die Ermittlungsfähigkeiten des Teams. Jane arbeitet indes von ihrem Krankenhauszimmer aus, während sie zusammen mit Maura und ihrer Familie versucht, einen schrecklichen Verlust zu verarbeiten.
Die Beamten wollen Korsak bei einem alten Fall helfen, bei dem schon seit langer Zeit keine neuen Beweise ans Licht gekommen sind. Angela versteckt indes ein Schreiben, in dem steht, dass ihre Tochter wieder zum Dienst erscheinen darf. Jane kann nicht fassen, dass sie noch nicht zurück auf das Revier darf und versucht mit ungewöhnlichen Methoden, bei den Fällen auf dem Laufenden zu bleiben.
Mitten in einer Hitzewelle müssen Jane und Maura den Tod eines Mannes aufklären, der in einer Badewanne voll Eis gefunden wurde. Bei der Autopsie stellt Maura fest, dass der Mann stranguliert wurde. Angela versucht indes, sich auf andere Art abzukühlen. Sie hat einen Tee gefunden, der Abkühlung verspricht, doch das Getränk hat unerwartete Konsequenzen.
Zapatas Verstöße holen sie ein und sie findet sich im Gefängnis wieder, zusammen mit einem potenziell mächtigen Sandstorm-Mitglied namens Devon (RONDA ROUSEY).
Das Team bringt endlich ein Mitglied von Sandstorm zum Reden, was zu einem riesigen Durchbruch bei der Aufdeckung von Phase 2 führt.
Als das FBI eine Tragödie meistert, befindet sich Weller inmitten eines überraschenden Ereignisses. Und Jane steht im Staffelfinale vor einer unsicheren Zukunft.
BRAVO wird nach Syrien zurückberufen, um einige ungelöste Probleme zu klären.
BRAVO begibt sich nach Amman, Jordanien, um den iranischen General zu finden, der Yasiris Milizen unterstützt.
Nach einem erfolgreichen Verhör in Jordanien erhält BRAVO eine verheerende Nachricht, die das Team für immer verändern wird.
François Duval, ein russisch-kanadischer Doppelagent, der verdeckt eine Ballettschule leitete, wurde durch ein dubioses Gift getötet. Zuerst ist unklar, dass François ein Geheimagent war, doch als Charlie das mithilfe seines Teams herausgefunden hat, überschlagen sich die Ereignisse und sogar auf Charlie wird ein Giftanschlag verübt.