Piper und Sam werden von Japanern auf ein U-Boot aus dem Zweiten Weltkrieg entführt. Als die übrigen Mitglieder des NTSF-Teams das mitbekommen, starten sie eine Rettungsaktion.
Das NTSF-Team hat die Aufgabe den neuen Teilchenbeschleuniger von San Diego zu beschützen. Als Trent in den Reaktorraum geht, gerät er in ein Paralleluniversum.
Piper ist ein Schläfer und wird wieder aktiviert. Dadurch entwickelt sie sich zur gemeingefährlichen Killerin und verursacht Chaos im NTSF-Hauptquartier.
Dr. Tracy findet heraus, dass Mike in großer Gefahr schwebt.
Das Team muss angebrütete Straußeneier retten.
Jessica signiert in einer Buchhandlung in San Francisco gerade ihr neues Buch, da trifft sie ihren alten Bekannten Dennis Stanton wieder, der ihr von einem tückischen Fall erzählt...
Jessica macht Urlaub in Nashville, um dort ihre Freundin, die Country-Sängerin Patti Sue Diamond, und deren Mann Bobby zu besuchen. Doch bald darauf wird Bobby vergiftet...
Jessica hat eine Videokassette von ihrem Freund Dennis Stanton bekommen, auf der er eine wahre Begebenheit schildert, die sich ausgezeichnet als Romanvorlage eignet...
Seth führt Jessica in großem Stil aus. Allerdings hat der Besitzer seines Lieblingsrestaurants gewechselt und nun findet in einem Hinterzimmer ein Festessen zu Ehren eines Mafia-Bosses statt...
Während eines romantischen Diners mit seiner Geliebten Christina Hellinger erfährt Dennis Stanton, dass ihr Mann um ihre Affäre weiß. Nun droht dieser damit, seinen Rivalen umzubringen...
Sheriff Metzger bekommt Probleme mit dem Botschafter Chandler Hellman, als er dessen Sohn verhaftet. Als dieser nach seiner Freilassung ermordet wird, verschärft sich die Situation für den Sheriff...
Aus heiterem Himmel werden Marys Noten in der Schule schlechter. Keiner kann sich einen Reim darauf machen, bis Charles aufgeht, dass seine Tochter aus weiterer Distanz nicht mehr gut sehen kann und ihr eine Brille kauft. Umgehend ist sie wieder Klassenbeste. Doch die anderen Kinder machen sich über Marys Brille lustig, was dem Mädchen so sehr zusetzt, dass es die Brille "verliert".
Walnut Grove soll seine erste eigene Bank bekommen, deren Leitung der hartherzige Mr. Sprague übernimmt. Der erfahrene Banker lässt sich von niemandem erweichen, auch nicht von Charles, der dringend einen Kredit benötigen würde. Derweil freundet sich Laura beim Fischen mit einem älteren Mann an und hat keine Ahnung, dass es sich bei ihm um Mr. Sprague handelt.
Walnut Grove ist beim letzten Baseballspiel gegen Sleepy Eye mit fliegenden Fahnen untergegangen. Dieses Jahr soll aber alles anders werden: Statt Nels Olesons tritt nun Mr. Mumford an und überzeugt jeden mit seiner hervorragenden Wurftechnik. Als seine rechtschaffene Frau aber erfährt, welch hohe Summen auf das Spiel gesetzt werden, verbietet sie ihm, daran teilzunehmen. Nun ist guter Rat teuer.
Nellie bringt Laura dazu, entgegen aller Verbote von Vater Charles das Haus des als Spinner geltenden Mr. Pike aufzusuchen. Vor Ort erfährt Laura, dass der alte Mann noch immer auf die Rückkehr seiner verstorbenen Frau wartet, und versucht daraufhin, ihm bei seiner Trauer zu helfen.
Der jährliche Frühlingstanz steht kurz bevor, doch weder Laura noch Grace Snider haben eine männliche Begleitung. Caroline hat das Gefühl, dass Isaiah Edwards sich nicht genügend um Grace bemüht und gibt der jungen Frau ein paar Tipps. Laura, die das Gespräch mitangehört hat, wendet die Ratschläge ihrer Mutter bei sich selbst an, doch der Schuss geht nach hinten los.
Als es bei einem Autorennen einen Toten gibt, versucht das Team, möglichst schnell die Hintergründe des Falls aufzuklären. Nachdem immer mehr Hinweise ans Tageslicht gelangen, vermutet Jane, dass mit dem Mord eigentlich ein Drogengeschäft vertuscht werden sollte. Als sie sich an Martinez wendet und um Unterstützung bei ihren Ermittlungen bittet, rennt sie jedoch gegen verschlossene Türen.
An einem College werden für angehende Juristen Scheinprozesse abgehalten, bei denen die Studenten ihr Talent als Strafverteidiger oder Staatsanwalt unter Beweis stellen dürfen. Für eine der Studentinnen nimmt der Unterricht jedoch kein gutes Ende: Sie kommt unter tragischen Umständen ums Leben. Jane macht sich indes Sorgen, ob ihre Mutter Angela eventuell Geldsorgen plagen.
Gibbs besucht die Gedächtnis-Andacht für einen Freund, der auf See gestorben ist. Dabei entdeckt er, dass sich der angeblich verstorbene Navy Captain Brooks versteckt hat, nachdem dessen Boot auf See angegriffen wurde.
Sloane ist davon überzeugt, dass ein Mann, der sie in Afghanistan gefangen gehalten und gefoltert hat, und der angeblich nach ihrer Rettung getötet wurde, in Washington D.C. ist. Vance und Gibbs fürchten, dass Sloane den Mann töten wird.
Das MPU sucht nach einer Studentin, die während einer Hausparty verschwunden ist. Unterdessen versuchen Sidney und Keith, sich wieder an das normale Leben zu gewöhnen.
Das MPU folgt der Spur des entführten Sohn eines Arztes; Kemi äußert ihre Sorge um Sidneys Wohlergehen.
Zapatas Verstöße holen sie ein und sie findet sich im Gefängnis wieder, zusammen mit einem potenziell mächtigen Sandstorm-Mitglied namens Devon (RONDA ROUSEY).
Das Team bringt endlich ein Mitglied von Sandstorm zum Reden, was zu einem riesigen Durchbruch bei der Aufdeckung von Phase 2 führt.
Als das FBI eine Tragödie meistert, befindet sich Weller inmitten eines überraschenden Ereignisses. Und Jane steht im Staffelfinale vor einer unsicheren Zukunft.
François Duval, ein russisch-kanadischer Doppelagent, der verdeckt eine Ballettschule leitete, wurde durch ein dubioses Gift getötet. Zuerst ist unklar, dass François ein Geheimagent war, doch als Charlie das mithilfe seines Teams herausgefunden hat, überschlagen sich die Ereignisse und sogar auf Charlie wird ein Giftanschlag verübt.
Im Deer Lake Gefängnis wird David, ein Häftling, mit einem Messer ermordet. Um herauszufinden, was genau passiert ist, lässt sich Charlie dort als Gefangener einschleusen. Anfangs läuft alles nach Plan, doch dann taucht ein Häftling auf, der von Charlie hinter Gitter gebracht wurde. Er droht Charlies Identität auffliegen zu lassen. Die Lage für Charlie wird immer gefährlicher.
Charlies Vater Edward ist Commander bei der Navy und mit seinem Schiff zu Besuch im Hafen von St. John's. Das Verhältnis der beiden ist ohnehin schon angespannt, doch als eine Polizistin in der Umgebung einer örtlichen Partymeile ermordet wird und einige Matrosen damit in Zusammenhang zu stehen scheinen, verhärten sich die Fronten zusehends.
Hina und Kainalu bewerben sich bei den Rettungsschwimmern um Captain Harlan "Sonny" Jennings, Lieutenant Em Wright, Will Ready und Laka Hanohano.
Sonny, Em und Will versuchen eine junge Touristin zu retten, die von einer Sturzflut ins Meer gespült wurde. Doch dabei gerät Em selbst in Gefahr.
Die Entführung eines jungen Mädchens ist wahrscheinlich eine Racheaktion, die mit der Arbeit ihres Vaters zu tun hat.
Eine Frau schlägt einen Mann nieder und zwingt ihn mit vorgehaltener Schusswaffe, in ihr Auto zu steigen.
Das MPU sucht nach einer Studentin, die während einer Hausparty verschwunden ist. Unterdessen versuchen Sidney und Keith, sich wieder an das normale Leben zu gewöhnen.
Das NTSF-Team bekommt neue SUVs, die mit künstlicher Intelligenz ausgestattet sind. Innerhalb kürzester Zeit beginnen die SUVs verrückt zu spielen.
Das Team muss angebrütete Straußeneier retten.