Dem Präsidenten der Navy wird das Herz aus der Brust entwendet und durch eine Bombe ersetzt. Das NTSF-Team versucht ihn zu retten.
Der ehemalige Boxer Joe Kagen lässt sich in Walnut Grove nieder und möchte sonntags die Messe besuchen. Einige Mitglieder der Gemeinde haben jedoch etwas dagegen, dass der schwarze Kagen in ihrer Kirche auftaucht. In Winoka erfahren Mary und Adam indes, dass das Schulgebäude verkauft wurde und sie mit ihren Schülern ausziehen müssen. Nun ist guter Rat teuer.
Mary und Adam sind mit ihren Schülern auf dem Weg von Winoka nach Walnut Grove, wo sie glücklicherweise eine geeignete Unterkunft für ihre Blindenschule gefunden haben. Besonders Mrs. Oleson, die die Kinder begleitet, muss auf der Reise einige Vorurteile überdenken. Adam gesteht zudem, dass er seit dem schweren Unfall, bei dem er erblindet ist, Angst vor tiefem Wasser hat.
Nach dem Tod der kalifornischen Lottofee wird Monks Assistentin Natalie ihre Nachfolgerin, doch Monk reagiert empfindlich auf den Ruhm seiner Kollegin. Dann wird Natalie in einen Manipulationsskandal bei der Lottogesellschaft verwickelt.
Monk zittert vor dem Fitnesstest der Polizei, da er seine sportlichsten Tage hinter sich hat. Aber dann wird der Fall eines Boxprofis, auf den ein Mordanschlag verübt wurde, für Monk zum beinharten Trainingscamp.
Monk wird gebeten, einen angeblichen Selbstmord auf einem U-Boot zu untersuchen. Trotz seiner Klaustrophobie lässt er sich überreden, den Tatort kurz zu besichtigen. Doch genau in diesem Moment bricht der Kapitän zur Manöverfahrt auf - und bei Monk die Panik aus.
Monk verliebt sich in eine Frau, die unter Mordverdacht steht. Trotz erdrückender Beweise - plus ihrem Geständnis - ist Monk fest entschlossen, ihre Unschuld zu beweisen.
Monks 100. Fall ist eine Mordserie. Bei der Aufklärung wird er von einem Fernsehteam begleitet. Aber als alle gemeinsam die fertige Sendung anschauen, fällt Monk auf, dass eins der Opfer nicht von dem überführten Täter umgebracht wurde.
Monk, der seit dem Tod seiner Frau psychisch angeschlagen ist, sucht bei einem Hypnotiseur Hilfe. Der versetzt ihn in sein früheres Ich und von nun an benimmt sich Monk wie ein Kind - wie soll er so einen Mordfall lösen?
Während Jane von einer Serie von Enthüllungen über ihre Tätowierungen erschüttert wird und mit der Entscheidung kämpft, ob sie Oscar vertrauen kann, verfolgt das Team einen Fall ins Ausland.
Nachdem ein gestörter Irak-Veteran einen Stützpunkt hochschießt, enthüllt das Team eine Verschwörung, und Jane und Weller müssen einem zielstrebigen Wissenschaftler Einhalt gebieten.
Als ein Hinweis zeigt, dass sich ein Spion im New Yorker Büro des FBI befindet, muss das Team nach ihm jagen, während es der extrem genauen Prüfung von Inspektor Fischer ausgesetzt ist.
Als Jane erwägt, das FBI zu verlassen, macht sich das Team wegen eines anonymen Tipps an die Untersuchung eines dringenden Todesstrafenfalls - und Zapata arbeitet schließlich undercover.
Nachdem ein Gemälde mit einem von Janes Tattoos aus einer Galerie geraubt wird, entdeckt das Team, dass Jane das eigentliche Ziel ist. Um ihr Team zu schützen, desertiert Jane.
Als ein gepanzerter Lastwagen ausgeraubt wird, entdeckt das Team, dass die gestohlenen Waren chemische Waffen sind, und muss sich beeilen, um einen tödlichen Terroranschlag zu verhindern.
Nachdem Patterson eine versteckte Botschaft in einem Kreuzworträtsel entdeckt, begibt sie sich auf eine gefährliche Tattoo-Schnitzeljagd. Oscar erzählt Jane mehr über ihre Vergangenheit.
Um einen gefährlichen internationalen Kriminellen zu fangen, müssen Jane und Weller mit einem unwahrscheinlichen Verbündeten zusammenarbeiten: ihrem früheren Ziel Rich DotCom (ENNIS ESMER).
Als bei der Untersuchung eines Tattoos ein Schulamoklauf ausbricht, teilt sich das Team auf, um den Schützen zu stellen. Mayfair beschäftigt sich mit einigen Dingen aus ihrer Vergangenheit.
Als ein Mädchen mit einer Tattooverbindung von Borden betreut wird, bringt er sie zum FBI-Team, aber ihre Verbindungen zu einer Terrororganisation entpuppen sich für alle als gefährlich.
Nachdem sich das Team gegen die Führungsebene gestellt und für eine bessere Gesundheit der Soldaten eingesetzt hat, wird BRAVO ins Abseits gedrängt und schließlich mit einem wenig erfreulichen Auftrag nach Schweden geschickt.
BRAVO findet sich am Schauplatz eines Terroranschlags in Schweden wieder und Jason überlebt nur knapp. Leutnant Davis stellt ihrer neuen Einheit ein Ultimatum und ein Familienmitglied überrascht Drew mit einer mysteriösen Warnung.
Bei einer archäologischen Expedition auf der Bouvetinsel in der Antarktis entdeckt eine Gruppe Wissenschaftler einen Tunnel, der mit außerirdischer Technik gebohrt worden sein muss. Als sie durch ihre Erkundungen versehentlich eine gefangene Alienkönigin wecken, gerät das Team zwischen die Fronten eines alten Krieges zwischen Aliens und Predatoren.
Nachdem sich das Team gegen die Führungsebene gestellt und für eine bessere Gesundheit der Soldaten eingesetzt hat, wird BRAVO ins Abseits gedrängt und schließlich mit einem wenig erfreulichen Auftrag nach Schweden geschickt.
BRAVO findet sich am Schauplatz eines Terroranschlags in Schweden wieder und Jason überlebt nur knapp. Leutnant Davis stellt ihrer neuen Einheit ein Ultimatum und ein Familienmitglied überrascht Drew mit einer mysteriösen Warnung.
Bei einer archäologischen Expedition auf der Bouvetinsel in der Antarktis entdeckt eine Gruppe Wissenschaftler einen Tunnel, der mit außerirdischer Technik gebohrt worden sein muss. Als sie durch ihre Erkundungen versehentlich eine gefangene Alienkönigin wecken, gerät das Team zwischen die Fronten eines alten Krieges zwischen Aliens und Predatoren.
Das Criminal Investigative Department befindet sich gemeinsam mit dem NCIS-Team mitten in einer hochgefährlichen Operation. Ziel des riskanten Unterfangens ist es, eine Festplatte zurückzuerlangen, auf der sich sensible militärische Daten befinden.
Ein Navy Seal wird attackiert, während er schwarz als Sicherheitsmann für eine erfolgreiche Marihuana-Apotheke arbeitet und Sam schwört, den Täter aus Respekt für die Navy Seal-Bruderschaft zu fassen.
Nachdem Anna Kolcheck mit ihrer Zellengenossin aus dem Gefängnis entkommt, helfen Callen und das NCIS-Team bei der Untersuchung und der Suche nach ihrem Aufenthaltsort.
Die Agenten Trent Hauser und seine Kollegin Piper Ferguson, die beide der Spezialabteilung NTSF:SD:SUV:: (National Terrorism Strike Force: San Diego: Sport Utility Vehicle) angehören, geben sich als Schüler aus, um an einer Highschool ermitteln zu können. Dort sind bereits mehrere Kinder einflussreicher Eltern entführt worden.
Trent Hauser und sein Team haben einen neuen Fall auf dem Schreibtisch: Die Polizisten müssen eine Gruppe Terroristen ausschalten und ermitteln dafür verdeckt bei einem Rikscha-Rennen in der Stadt.
Jessica wird Augenzeugin eines Mordes. Sie wird daraufhin zu ihrer eigenen Sicherheit verhaftet, weil ein gefährlicher Attentäter mit dem Decknamen 'Kobra' es auf sie abgesehen hat.
Monk verliebt sich in eine Frau, die unter Mordverdacht steht. Trotz erdrückender Beweise - plus ihrem Geständnis - ist Monk fest entschlossen, ihre Unschuld zu beweisen.
Monks 100. Fall ist eine Mordserie. Bei der Aufklärung wird er von einem Fernsehteam begleitet. Aber als alle gemeinsam die fertige Sendung anschauen, fällt Monk auf, dass eins der Opfer nicht von dem überführten Täter umgebracht wurde.