11:10
Ein Flugzeug ist abgestürzt, doch von der Pilotin fehlt jede Spur. Bald sind die Ermittler davon überzeugt, dass die Frau ihren Tod vortäuschen wollte. McGee muss indes eine schwierige Entscheidung treffen und sucht Rat bei seinen Kollegen.
11:55
Auf einem Übungsgelände für Drohnenflüge wird ein Toter gefunden. Gibbs und sein Team sollen feststellen, ob es sich um einen Unfall oder Mord handelt. Palmer führt indes Bewerbungsgespräche für die Assistenzstelle in der Gerichtsmedizin.
12:40
Torres und Bishop sind gerade beim Joggen, als der NCIS-Agent von einem Raser angefahren wird. Während Torres auf der Intensivstation um sein Leben kämpft, nehmen Bishop und die anderen Kollegen die Ermittlungen auf.
13:25
Gibbs' Freund Phillip Brooks hat auf einer Dating-Website eine Frau kennengelernt, die allerdings Hauptverdächtige in zwei Mordfällen ist. Sloane hat zudem am Valentinstag einen geheimen Verehrer und Torres darf das Krankenhaus verlassen.
14:10
Ein Navy-Offizier hat sich umgebracht und dem Navy-Museum eine kostbare - aber wohl gestohlene - Münze vermacht. Während die Ermittler die Todesumstände untersuchen, stellen sie sich die Frage, wie der Mann in den Besitz der Münze kam.
15:00
Das Team steht vor einem Rätsel: Ein Navy-Offizier wurde auf exakt die gleiche Art getötet wie seine Eltern zehn Jahr zuvor. Zudem wollen die Kollegen ein paar Dinge für einen guten Zweck spenden, doch das gelingt nicht allen auf Anhieb.
15:40
In einem See wird die Leiche eines sehr geschätzten Navy-Technikers gefunden. Bei den Nachforschungen finden die Ermittler heraus, dass der Mann wohl ein Hacker war. Zudem bittet Faith ihre biologische Mutter Sloane um einen Gefallen.
16:25
Detective Rizzoli und ihre Freundin Dr. Isles versuchen, den Mord an einer Frau aufzuklären, die erschlagen vor einer Lesben-Bar aufgefunden wird. Handelt es sich bei dem Mord um ein Verbrechen aus Hass gegen Homosexuelle oder ist doch jemand aus dem privaten Umfeld der Frau für die Tat verantwortlich? Jane ermittelt verdeckt, um dem Täter auf die Spur zu kommen.
17:10
Als wie jedes Jahr in Boston der Marathon stattfindet, möchten auch Jane und ihre Freundin Maura ihre Kondition unter Beweis stellen. Weit kommen die beiden Frauen allerdings nicht, denn schon nach wenigen Kilometern entdecken sie einen erschossenen Läufer. Um eine Massenpanik unter den Sportlern zu verhindern, versuchen sie, die Leiche geheim zu halten ? doch bald wird der nächste Tote entdeckt.
17:55
In einem Park in Boston wird ein Toter mit durchgeschnittener Kehle gefunden. Schnell machen Rizzoli und ihre Kollegin Dr. Isles eine schreckliche Entdeckung: Der Mann wurde bereits vor über zwei Jahren getötet und seither tiefgekühlt gelagert. Die Verletzungen deuten auf den inhaftierten Serienmörder Hoyt hin, der bereits zweimal versucht hat, Jane zu töten. Hat Hoyt etwa einen Komplizen?
18:40
Detective Jane Rizzoli und ihre Kollegin Maura Isles sollen den Mord an einem jungen Mann aufklären, der tot in seinem Auto gefunden worden ist. Seltsam ist, dass das seine Fingerspitzen mit Säure behandelt hat, um Fingerabdrücke zu vermeiden. Warum wollte der junge Mann seine Identität verbergen? Als sich herausstellt, dass er Mauras Halbbruder war, überschlagen sich die Ereignisse.
19:30
Als die Tarnung eines Polizisten auffliegt, der verdeckt im Drogenmilieu ermittelt, wird er kurzerhand von Mitgliedern der Mafia erschossen. Nachdem Detective Rizzoli und ihr Bruder Frank den Tatort untersucht und einige Beweisstücke sichergestellt haben, kehren sie aufs Revier zurück. Doch bald stürmen Mitglieder des Drogenrings die Dienststelle. Sie sind auf der Suche nach etwas ganz Bestimmtem.
20:15
Im Auftakt der zweiten Staffel wird Jane Rizzoli während einer Belagerung des Reviers angeschossen und daraufhin als Heldin geehrt. Doch ein Desaster kürzt die Feier drastisch ab.
21:00
Janes und Mauras Ruhetag in einem Wellness-Center bringt reichlich Unruhe, als sie eine ermordete schwangere Frau entdecken, die ihr Kind als Leihmutter austrug.
21:45
Während der Flottenwoche wird ein junges Mädchen tot aufgefunden. Zwischen Frost und seinem Vater, Admiral der Navy, kommt es zu Spannungen. Maura geht mit Angelas Mechaniker aus.
22:30
Als die Tochter eines Polizisten vor den Augen ihres jüngeren Bruders entführt wird, suchen Jane und das Team hektisch nach ihr.
23:15
Der Trainer eines Baseball-Teams wird tot aufgefunden, während die Eigner und ein Star-Spieler um die Kontrolle des Teams kämpfen. Janes Bruder Tommy wird aus der Haft entlassen.