Das Team vom Firehouse 51 rückt zu einem Großbrand aus, bei dem viele Menschenleben in Gefahr sind. Eine alte Fabrik, die heute zum Wohnen und für Freizeitaktivitäten genutzt wird, wird schnell zur Feuerfalle. Die düstere Situation nimmt eine persönliche Wendung, als bekannt wird, dass unter den dort eingeschlossenen Menschen auch ein Familienangehöriger eines Mitglieds der Chicagoer Polizei ist. Nach der Katastrophe bietet der Eigentümer des Gebäudes seine Hilfe bei den Ermittlungen an, doch bald wendet sich die Situation.
Als ein Bandenkrieg in der Nachbarschaft des Firehouse 51 eskaliert, verschanzen sich einige bewaffnete Mitglieder einer Gang in der Feuerwache und nehmen die nichtsahnenden Feuerwehrleute als Geiseln. Die Lage nimmt noch an Ernst zu, als sich herausstellt, dass einer der Eindringlinge schwer verletzt ist und dringend ärztliche Hilfe benötigt.
Als eine Reihe sich ähnelnder Autounfällen den Verdacht nahelegen, dass es jemand auf unschuldige Menschen abgesehen hat, nimmt sich Dawson (Monica Raymund) auf eigenen Faust der Angelegenheit an. Severide (Taylor Kinney) unternimmt alles Menschenmögliche, damit sich Anna (Charlotte Sullivan) in Chicago wohlfühlt. Herrmann (David Eigenberg), Kidd (Miranda Rae Mayo) und Dawson beschließen, trotz großer Bedenken von Otis (Brian Zvonecek), das Molly's als Station in die diesjährige Kneipentour aufzunehmen, während Casey (Jesse Spencer) seinen Stadtratspflichten nachkommt.
Aus dem Meer wird eine Waffe gefischt, mit der mindestens zwei Menschen getötet wurden. Wer ist der Besitzer? McGarrett und Catherine stehen in ihrer Beziehung an einem Wendepunkt.
Der Millionär Harrison Crane wird mit einem Pfeil in der Brust tot im Wald aufgefunden. Bei der Leiche finden die Ermittler eine Million Dollar Falschgeld. Adam wird indes von der Yakuza entführt.
Der Besitzer einer Restaurantkette wird in seinem Büro mit einem Kopfschuss getötet. Der Killer entkommt über das Hausdach - auf einem Motorrad. Steckt die samoanische Mafia hinter dem Mord?
Kurz vor Halloween treibt ein moderner Dr. Frankenstein sein Unwesen, der Körperteile verschiedener Frauen sammelt. Maskierte überfallen zudem eine Blutbank. Grace geht unerlaubt auf eine Party.
McGarrett geht mit der Psychologin Lynn tauchen. Auf einer verlassenen Insel machen sie eine folgenreiche Entdeckung. Kono, Chin und Lou versuchen unterdessen, bei einem Footballspiel zu entspannen.
Ein Ladeninhaber wird in seinem Geschäft niedergeschossen. Für Atwater wird der Fall sehr persönlich.
Ruzeks Vater Bob wird von einer Bande entführt, die ihn gegen einen Informanten austauschen will. Adam muss sich Bobs Vergangenheit stellen.
Ein traumatisierter Afghanistanveteran wird beschuldigt, seine Frau ermordet zu haben. Er flieht auf ein Museumsschiff und nimmt Geiseln. Kann McGarrett die Situation entschärfen?
Dannys Ex-Kollege Meka wird grausam ermordet. Die Ermittlungen in dem Mordfall starten zögerlich, denn die Dienstaufsicht beschlagnahmt alle Akten: Meka soll korrupt gewesen sein.
Es gibt Hinweise, dass bei einem Kongress auf Hawaii ein Attentat auf den brutalen Militärgeneral Pak verübt werden soll. Kann das Team um McGarrett die Strippenzieher rechtzeitig stellen?
Eine Bande plant einen großen Diamantenraub während des Honolulu-Triathlons. Die Verdächtigen wohnen direkt gegenüber von Dannys Ex-Frau. Also nisten sich Danny und Steve bei ihr ein.
Im Wald wird eine Frau entdeckt, die sich an nichts erinnert. Ihr Mann wird ermordet aufgefunden. Sie scheinen Opfer eines Serienkillers zu sein, der Jagd auf frischverheiratete Paare macht.
An Weihnachten verdirbt eine Entführung die Festtagsstimmung: Chin Ho wird mit Sprengstoff an seinem Körper festgehalten, um Lösegeld zu erpressen. Der Täter ist für McGarrett kein Unbekannter.
Eigentlich wollte Brennan Werbung für ihr neues literarisches Werk machen, doch fordert ein Brandopfer ihre ganze Aufmerksamkeit. Und deren Sohn, der wohl aus dem Auto entführt wurde.
Booth wird zu einem Leichenfund gerufen. Obwohl einiges für einen Suizid spricht, holt sich der von Bones eine zweite Meinung ein. Und tatsächlich fallen der Anthropologin Ungereimtheiten auf.
Die Polizei stößt bei einer Verkehrskontrolle auf eine verweste Leiche. Zugleich wird ein Anschlag auf die Cops verübt. Booth tippt auf rivalisierende Gangs, Bones verfolgt eine ganz andere Spur.
Auf einem Golfplatz geht ein Jet der Regierung zu Boden. Für die fünf registrierten Insassen kommt jede Hilfe zu spät. Und noch eine weitere, ältere Leiche taucht auf. Jede Menge Arbeit für das Team.
Brennan und Booth haben zwei brisante Fälle zu lösen: Neben dem eines toten Mafia-Paten auf dem Grund eines Sees gilt es, einem Mehrfachmörder das Handwerk zu legen.
Ihre Ermittlungen führen Bones und Booth in ein Tunnelsystem unterhalb der Stadt. Hier fanden offenbar Dreharbeiten statt. Wurde dem Opfer die geheime Schatzkammer zum Verhängnis?
Von Angelas Lover und seinem Begleiter fehlen seit Tagen jede Spur. Als in der Wüste ein menschlicher Schädel gefunden wird, muss Angela mit dem Schlimmsten rechnen und bittet Brennan um Hilfe.
Ein Abenteurer stößt auf die Leiche eines Tauchers, der ein uraltes Knochenfragment bei sich trägt Nun ist der Entdeckergeist von Booth und Hodgins geweckt.
Bones leidet unter dem plötzlichen Verlust ihres Kurzzeitgedächtnisses. Eine der wenigen Erinnerungen betrifft das Treffen mit einem alten Bekannten - der jetzt Opfer eines Verbrechens ist.
Ein seltsames Krankheitsbild bei der Tochter eines FBI-Agents beschäftigt Brennan. Sie ist sicher, dass die Teenagerin nicht auf natürliche Weise erkrankt sein kann und beginnt mit Nachforschungen.
Während einer Observierung trifft das Team auf einen erschütterten Vater, dessen ermordeter Sohn Verbindungen zu einer Gang hatte.
Ruzek und das Team müssen sich bei einem Einsatz auf einen Süchtigen verlassen. Ruzek zweifelt an sich, als er einen Dealer erschießen muss.
Nach einer Schießerei in aller Öffentlichkeit bekommen Ruzek und Atwater den Auftrag zu einer Festnahme.
Ein Ladeninhaber wird in seinem Geschäft niedergeschossen. Für Atwater wird der Fall sehr persönlich.
Ruzeks Vater Bob wird von einer Bande entführt, die ihn gegen einen Informanten austauschen will. Adam muss sich Bobs Vergangenheit stellen.
Casey (Jesse Spencer) entdeckt ein neues Crack-Haus, in dem ein weiblicher Junkie Unterschlupf gefunden hat. Er greift zu extremen Mitteln, um die Situation in Ordnung zu bringen. Dawson (Monica Raymund) und Brett (Kara Killmer) bekommen für die Schicht einen Praktikanten zugeteilt. Der Neue bringt die beiden auch prompt in Schwierigkeiten. In der Zwischenzeit bekommt Severide (Taylor Kinney) unangekündigt Besuch von seinem Vater Benny (Treat Williams), und Herrmann (David Eigenberg) muss seinem Sohn helfen, der sich in der Schule in Schwierigkeiten gebracht hat.
Nachdem die Ausrüstung des Teams im Einsatz versagt hat, trifft Casey (Jesse Spencer) seinen alten Freund und Kollegen Jason Kannell (Kamal Angelo Bolden) von der sechsten Einheit wieder. Dessen Truppe unterstützt Caseys Revier, bis das Ausrüstungsproblem gelöst ist. Dawson (Monica Raymund) und Brett (Kara Killmer) nutzen die Zeit für eine Fortbildung und bewältigen den Kurs jeweils auf ihre eigene Weise. Severide (Taylor Kinney) versucht unterdessen, die Lage mit Anna (Charlotte Sullivan) zu verbessern und bekommt dabei unerwartete Unterstützung.