Nach dem Mordanschlag auf Beckett während Captain Montgomerys Beerdigung warten ihre Kollegen vergeblich darauf, dass sie sich bei ihnen meldet. Erst drei Monate später kehrt sie ins Revier zurück. Castle ist mittlerweile nicht mehr für die Polizei tätig, da er es zu Differenzen zwischen ihm und der Leiterin Captain Victoria Gates gekommen ist. Nachdem Beckett eine Schießprüfung ablegen muss um ihre Waffe zurückzuerlangen, soll sie den Mord an einem Promigirl aufklären.
Ein Mann, der in einer Seitenstraße versuchte, eine Frau zu vergewaltigen, wird Opfer eines brutalen Mordes: Der Täter schlägt dem Angreifer mit einem Schwert die Hand ab und zerteilt ihn anschließend der Länge nach. Beckett und Castle führend die Ermittlungen in dem Fall in eine Welt von Möchtegern-Superhelden. Auch privat ist in Castles Leben einiges los: Alexis schockiert ihren Vater mit der Neuigkeit, dass sie in Kalifornien studieren möchte.
Aufgrund seines Schmerzmittelentzugs stellt House eine fehlerhafte Diagnose: Er will einem kleinen Mädchen Arm und Bein amputieren lassen. Bevor es dazu kommt, schreitet Cuddy energisch ein.
House wird suspendiert und sieht zudem einem Gerichtsverfahren entgegen. Wilson fädelt für seinen Freund einen Deal ein: Macht House eine Therapie, kann er den Prozess vermeiden.
House steht ein Prozess bevor. Er versucht mit einem Drogenentzug, seinen Kopf noch aus der Schlinge zu ziehen. Der Fall eines Verbrennungsopfers sorgt dabei für eine willkommene Ablenkung.
Atwater wird in ein gefährliches Drogenkartell eingeschleust, bald merkt er: Hinter der Fassade des Anführers scheint es ein Geheimnis zu geben.
Eine Leiche im Wald bringt einen seit fast hundert Jahren tobenden Krieg zwischen zwei Familien ans Tageslicht. Brennan (Emily Deschanel) und Booth (David Boreanaz) befragen die Mitgleider der verfeindeten Sippen und sind schockiert über deren Aussagen. Auch zu Hause gibt es Herausforderungen zu meistern. Brennans Vater (Ryan O¿Neal) will als Babysitter wiedergutmachen, was er in ihrer Kindheit versäumt hat. Sie hat zwiespältige Gefühle. Kann sie sich dieses Mal auf ihn verlassen?
Das neueste Buch von Brennan (Emily Deschanel) wird verfilmt, und sie reist mit Booth (David Boreanaz) nach Los Angeles zu den Dreharbeiten. Brennan hat an allem etwas auszusetzen, ob schauspielerische Leistungen oder falsche Darstellung ihrer Arbeit. Und dann entpuppt sich der Tote aus der Requisite auch noch als echt. Wer ist das Mordopfer und wer hat es auf dem Gewissen? Während das Filmprojekt endgültig zum Erliegen kommt, wird Booth mit einem Jobangebot überrascht.
Christopher Pelant (Andrew Leeds) ist dem Team um Brennan (Emily Deschanel) und Booth (David Boreanaz) wohlbekannt. Als das raffinierte Genie Berufung einlegt, warnen sie das Gericht, weil er bereits zweimal wegen Mordes verdächtigt wurde. Und auch das Opfer ihres aktuellen Falls könnte mit Pelant zu tun haben. Während alle im Jeffersonian fieberhaft daran arbeiten, endlich Beweise gegen ihn zu finden, dreht sich der Fall um 180 Grad. Nun wird ausgerechnet Brennan verdächtigt.
Brennan lebt seit drei Monaten untergetaucht, um einer Strafe zu entgehen. Angela findet bei ihren Nachforschungen heraus, dass eine seit zehn Jahren vermisste Lehrerin auch zu Pelants Opfern gehört.
Brennan und Booth tasten bei der Untersuchung eines Mordes an einem Scheidungsanwalt im Dunkeln. Im Laufe der Ermittlungen wird klar, dass Ehefrau des Ermordeten wichtige Informationen zurückhält.
Zum Wohle des Krankenhauses ist Cuddy gezwungen, House in die Ambulanz zu versetzen. In seiner neuen Arbeitsumgebung trifft der Diagnostiker auf ein Vergewaltigungsopfer, das ihm alles abverlangt.
Um seinen verlorenen Parkplatz zurückzugewinnen, bedient sich House einer ganz perfiden Taktik: Er sitzt eine Woche im Rollstuhl. Gleichzeitig treibt ihn die Familie eines Patienten zur Weißglut.
Unfallopfer Hannah klagt über einen sonderbaren Zustand: Sie kann keine Schmerzen empfinden. House legt sich bei diesem Fall derart ins Zeug, dass Wilson ein Verdacht kommt.
Was zunächst wie ein schlecht geplanter Autoraub aussieht, entpuppt sich als Teil eines viel größeren Plans. Voights Team legt sich mit einem Drogenboss an.
Brennan soll die Identität eines Explosionsopfers herausfinden und wird auf eine falsche Fährte gelockt. Während Booth anderweitig beschäftigt ist, hilft seine Kollegin Sparling bei den Ermittlungen.
Ein ehemaliger Besitzer eines Eisenwarengeschäfts stirbt, wie es zunächst scheint, an den Folgen einer Schussverletzung. Doch dann fällt Daisy eine Wunde auf, die nur von einem Raubtier stammen kann.
Eine tote Frau mit zahleichen Schnittwunden wird von Booth und Brennan als die erfolgreiche Apfelmushändlerin Jessica Pearson identifiziert. Wer könnte ein Motiv haben, die Unternehmerin zu töten?
Brennan beauftragt ihr Team mit der Untersuchung bisher unidentifizierter Leichen. Eines der Todesopfer scheint wenige Tage nach dem 11. September 2001 gestorben zu sein und wirft ein Rätsel auf.
Brennans Team untersucht eine männliche Leiche, die in Plastikfolie verpackt an den Strand gespült wurde. In der Zwischenzeit finden Angela und Hodgins heraus, dass Cam eine geheime Romanze hat.
Es gibt Tage, die sind einfach zum Vergessen. Nolan erfährt, dass seine Identität entwendet wurde und der Diebstahl seine Position als Officer beim LAPD gefährden könnte.
Lucy Chen und Kollege Bradford melden sich zum Casting bei "American Idol" in Los Angeles an. Bei ihrem Vorsingen treffen die beiden Polizisten auf Ryan Seacrest und die prominenten Juroren der Show.
Eine riesige Blutlache, aber keine Leiche - so beginnt der neuste Fall von Beckett und Castle. Die Reifenspur eines Lieferwagens führt zur Kryonikfirma "Passageway". Es stellt sich heraus, dass Mitarbeiter das Opfer vom Tatort entfernten, um es so schnell wie möglich einzufrieren und irgendwann in der Zukunft wiederzubeleben. Aber ohne Autopsie der Leiche scheint es für Beckett und Castle aussichtslos, den Mörder ausfindig zu machen.
Auf einer Baustelle wird die Leiche einer Studentin in flüssigem Beton entdeckt. Die Ermittlungen von Beckett und Castle ergeben, dass das Opfer mit Ryans Dienstwaffe erschossen wurde, die ihm vor einigen Monaten vom Dreifachmörder Jerry Tyson gestohlen wurde. Ryan fühlt sich schuldig am Tod der jungen Frau und schwört, Jerry Tyson zu finden.
Während der Eröffnungsfeier einer Ausstellung wird der Direktor des Museums ermordet - aufgespießt an einem Ausstellungsstück. Die Ermittlungen ergeben, dass Hayes besorgt war, dass das Kunstobjekt "Faust des Kapitalismus" gestohlen werden könnte. Und tatsächlich: Die Skulptur ist verschwunden. Um den Fall zu lösen, tauchen Beckett und Castle in die Welt der Kunst und Meisterdiebe ein.
Brennan soll die Identität eines Explosionsopfers herausfinden und wird auf eine falsche Fährte gelockt. Während Booth anderweitig beschäftigt ist, hilft seine Kollegin Sparling bei den Ermittlungen.
Ein ehemaliger Besitzer eines Eisenwarengeschäfts stirbt, wie es zunächst scheint, an den Folgen einer Schussverletzung. Doch dann fällt Daisy eine Wunde auf, die nur von einem Raubtier stammen kann.
Eine tote Frau mit zahleichen Schnittwunden wird von Booth und Brennan als die erfolgreiche Apfelmushändlerin Jessica Pearson identifiziert. Wer könnte ein Motiv haben, die Unternehmerin zu töten?
Brennan beauftragt ihr Team mit der Untersuchung bisher unidentifizierter Leichen. Eines der Todesopfer scheint wenige Tage nach dem 11. September 2001 gestorben zu sein und wirft ein Rätsel auf.
Brennans Team untersucht eine männliche Leiche, die in Plastikfolie verpackt an den Strand gespült wurde. In der Zwischenzeit finden Angela und Hodgins heraus, dass Cam eine geheime Romanze hat.
Eine riesige Blutlache, aber keine Leiche - so beginnt der neuste Fall von Beckett und Castle. Die Reifenspur eines Lieferwagens führt zur Kryonikfirma "Passageway". Es stellt sich heraus, dass Mitarbeiter das Opfer vom Tatort entfernten, um es so schnell wie möglich einzufrieren und irgendwann in der Zukunft wiederzubeleben. Aber ohne Autopsie der Leiche scheint es für Beckett und Castle aussichtslos, den Mörder ausfindig zu machen.
Auf einer Baustelle wird die Leiche einer Studentin in flüssigem Beton entdeckt. Die Ermittlungen von Beckett und Castle ergeben, dass das Opfer mit Ryans Dienstwaffe erschossen wurde, die ihm vor einigen Monaten vom Dreifachmörder Jerry Tyson gestohlen wurde. Ryan fühlt sich schuldig am Tod der jungen Frau und schwört, Jerry Tyson zu finden.