Mitchell schleust sich undercover in die Lucian-Allianz ein. So will er einen Bürgerkrieg zwischen den Allianzen verhindern. Außerdem muss er unter allen Umständen den Aufenthaltsort der entführten "Odysseus" herausfinden, um weitere Mitglieder des SG-1-Teams zu retten.
Mitchell und seine Mannschaft sind weiterhin auf der Suche nach dem heiligen Gral. Mit dessen Hilfe sollen die Ori endlich besiegt werden. Dabei finden sie heraus, dass offenbar noch jemand hinter dem Gral her ist.
Eli, Brody und Rush erkunden die Destiny. Unterdessen werden Mitglieder der Crew bei einer Erkundungsmission von einer Kreatur entführt. Werden sich alle aus den Fängen des Aliens befreien können?
Bei der Untersuchung des angeblichen Selbstmordes von Roberta Sim lernt Scully deren kleine Tochter Emily kennen. Die Ähnlichkeit mit Scullys Schwester Melissa ist verblüffend. Eine genetische Untersuchung ergibt tatsächlich eine große Übereinstimmung zwischen Emily und Melissa. Als Emilys Vater sich kurz darauf ebenfalls umbringt, ist Scully fest entschlossen, die vermeintliche Tochter ihrer verstorbenen Schwester zu adoptieren.
Mulder kommt hinter das Geheimnis der kleinen Emily, die verblüffende Ähnlichkeit mit Scullys verstorbener Schwester aufweist: Das Mädchen entstand aus Eizellen, die Scully während ihrer Entführung durch Außerirdische entnommen wurden. Scully bekommt schließlich das Sorgerecht zugesprochen. Da erfährt sie, dass Emily an einer tödlichen Krankheit leidet.
Robert Modell, der Pusher, bricht aus dem Gefängnis aus. Mulder und Scully machen sich auf die Suche nach dem gefährlichen Mann, der anderen seinen Willen aufzwingen kann. Bald finden sie sein erstes Opfer: Staatsanwalt Bowman, der Modell damals ins Gefängnis brachte.
Das Raumschiff "Ark One" verliert bei einer verheerenden Katastrophe große Teile seiner Crew. Nun liegt es an den verbliebenen Besatzungsmitgliedern, die Reise durchs All erfolgreich fortzusetzen.
Die Besatzung der "Ark One" ist weiter um Ordnung bemüht. Während die Wasserversorgung an Bord zunehmend kritischer wird, ergibt die Untersuchung der Katastrophe mehr Fragen als Antworten.
Die Wasserkrise auf der "Ark One" erreicht ihren Höhepunkt. Die angespannte Situation wird durch eine weitere Notlage verschärft: Das Raumschiff befindet sich auf Kollisionskurs mit einem Asteroiden.
Noch immer sucht das SG-1-Team nach dem heiligen Gral, um die Ori endgültig zu bezwingen. Der Kelch wird von einem Drachen bewacht. Nachdem sie den Drachen besiegt haben, werden das SG-1-Team und Ba'al auf einen anderen Planeten transportiert. Dort entdecken sie den Magier Merlin in einer Stasiskammer.
Mitchel, Carter und Teal'c reisen zu einem Planeten, der unter der Herrschaft der Ori steht. Mit einer neuartigen Technologie soll das gesamte Dorf versetzt und so aus der Gewalt der Tyrannen befreit werden. Doch dazu kommt es nicht mehr: Die Ori greifen an, zerstören einen Teil der Technik und verletzen Carter. Vala wird bei dem Angriff von ihrem Ehemann Tomin gefangen genommen.
Sam führt einen Test mit Merlins Gerät durch. Versehentlich transportiert sie sich dadurch in eine Parallelwelt. Landry herrscht dort als Präsident und auch das SG-1-Team hat sich völlig verändert. Sam will nichts lieber, als sofort wieder zurück in ihre Welt. Doch dazu bleibt erst mal keine Zeit, denn in dieser Realität wird die Erde von den Ori bedroht.
Während der Rest des SG-1-Teams beim Kampf mit Adria fliehen konnte, musste Daniel zurückbleiben. Kurze Zeit später erfahren Mitchell und sein Team, dass ein Prior der Ori unterwegs ist. Sie wollen sich mit diesem treffen, doch als dieser ankommt, sind alle fassungslos: Der Prior ist niemand anderer als ihr Freund Daniel.
Dem SG-1-Team gelingt es, drei von Netans Transportschiffen außer Gefecht zu setzen. Wütend setzt Netan ein Kopfgeld auf das Team aus. Unterdessen gibt General Landry seinem Team für einige Tage frei. Doch für Erholung bleibt keine Zeit, denn allen Mitgliedern sind plötzlich Auftragskiller auf den Fersen.
Mitchell und das SG-1-Team finden sich nach der Durchquerung des Stargates inmitten eines archäologischen Museums auf einem fernen Planeten wieder. Unerwartet werden sie von den Bewohnern angegriffen. Diese halten das Kommando für eine Gruppe von Gangstern, die Geiseln nehmen will. Um sich vor den Attacken zu schützen, sieht Mitchell keine andere Chance, als tatsächlich Geiseln zu nehmen.
Auf Talos IV zwingt Spocks Heilungsprozess ihn und Michael Burnham dazu, sich ihrer Vergangenheit zu stellen. Paul Stamets versucht, sich wieder dem distanzierteren Hugh Culber anzunähern.
Die Discovery-Crew infiltriert das Hauptquartier von Sektion 31 und findet Beunruhigendes heraus. Gibt es an Bord der Discovery einen Verräter? Michael Burnham versucht weiterhin, Spock zu helfen.
Bei der Untersuchung des angeblichen Selbstmordes von Roberta Sim lernt Scully deren kleine Tochter Emily kennen. Die Ähnlichkeit mit Scullys Schwester Melissa ist verblüffend. Eine genetische Untersuchung ergibt tatsächlich eine große Übereinstimmung zwischen Emily und Melissa. Als Emilys Vater sich kurz darauf ebenfalls umbringt, ist Scully fest entschlossen, die vermeintliche Tochter ihrer verstorbenen Schwester zu adoptieren.
Mulder kommt hinter das Geheimnis der kleinen Emily, die verblüffende Ähnlichkeit mit Scullys verstorbener Schwester aufweist: Das Mädchen entstand aus Eizellen, die Scully während ihrer Entführung durch Außerirdische entnommen wurden. Scully bekommt schließlich das Sorgerecht zugesprochen. Da erfährt sie, dass Emily an einer tödlichen Krankheit leidet.
Robert Modell, der Pusher, bricht aus dem Gefängnis aus. Mulder und Scully machen sich auf die Suche nach dem gefährlichen Mann, der anderen seinen Willen aufzwingen kann. Bald finden sie sein erstes Opfer: Staatsanwalt Bowman, der Modell damals ins Gefängnis brachte.
Kahlgeschoren gegen das Killer-Alien: Sigourney Weaver tritt im Teil drei der Sci-Fi-Saga auf einem Gefängnisplaneten gegen die tödliche Bestie an. Von "Fight Club"-Regisseur David Fincher.
Das Raumschiff "Ark One" verliert bei einer verheerenden Katastrophe große Teile seiner Crew. Nun liegt es an den verbliebenen Besatzungsmitgliedern, die Reise durchs All erfolgreich fortzusetzen.
Die Besatzung der "Ark One" ist weiter um Ordnung bemüht. Während die Wasserversorgung an Bord zunehmend kritischer wird, ergibt die Untersuchung der Katastrophe mehr Fragen als Antworten.
Die Wasserkrise auf der "Ark One" erreicht ihren Höhepunkt. Die angespannte Situation wird durch eine weitere Notlage verschärft: Das Raumschiff befindet sich auf Kollisionskurs mit einem Asteroiden.
Als der Geschäftsführer Blake Creighton eines Morgens tot in seiner Wohnung aufgefunden wird, wird der Fall an Detective Jules Dover und ihre Partnerin, die virtuelle Intelligenz Asha übergeben. Die ersten Befunde zeigen eindeutig, dass die Todesursache Strangulation gewesen sein muss. Doch Detective Dover und Asha finden keinerlei Hinweise auf Einwirkung von außen. Es scheint, als wäre Creighton ermordet worden, ohne vom Täter auch nur berührt worden zu sein.
Noch immer sucht das SG-1-Team nach dem heiligen Gral, um die Ori endgültig zu bezwingen. Der Kelch wird von einem Drachen bewacht. Nachdem sie den Drachen besiegt haben, werden das SG-1-Team und Ba'al auf einen anderen Planeten transportiert. Dort entdecken sie den Magier Merlin in einer Stasiskammer.
Mitchel, Carter und Teal'c reisen zu einem Planeten, der unter der Herrschaft der Ori steht. Mit einer neuartigen Technologie soll das gesamte Dorf versetzt und so aus der Gewalt der Tyrannen befreit werden. Doch dazu kommt es nicht mehr: Die Ori greifen an, zerstören einen Teil der Technik und verletzen Carter. Vala wird bei dem Angriff von ihrem Ehemann Tomin gefangen genommen.
Sam führt einen Test mit Merlins Gerät durch. Versehentlich transportiert sie sich dadurch in eine Parallelwelt. Landry herrscht dort als Präsident und auch das SG-1-Team hat sich völlig verändert. Sam will nichts lieber, als sofort wieder zurück in ihre Welt. Doch dazu bleibt erst mal keine Zeit, denn in dieser Realität wird die Erde von den Ori bedroht.
Während der Rest des SG-1-Teams beim Kampf mit Adria fliehen konnte, musste Daniel zurückbleiben. Kurze Zeit später erfahren Mitchell und sein Team, dass ein Prior der Ori unterwegs ist. Sie wollen sich mit diesem treffen, doch als dieser ankommt, sind alle fassungslos: Der Prior ist niemand anderer als ihr Freund Daniel.
Dem SG-1-Team gelingt es, drei von Netans Transportschiffen außer Gefecht zu setzen. Wütend setzt Netan ein Kopfgeld auf das Team aus. Unterdessen gibt General Landry seinem Team für einige Tage frei. Doch für Erholung bleibt keine Zeit, denn allen Mitgliedern sind plötzlich Auftragskiller auf den Fersen.