Der Leiche eines Mannes wurden alle Organe entnommen. Die Ermittlungen führen Mulder und Scully zu einer merkwürdigen Klinik und einer Sekte, die nach ewiger Jugend strebt.
Mit Tad O'Malleys Hilfe informiert Scully die Öffentlichkeit über die drohende Pandemie. Mulder will William aufspüren, hinter dem auch der Raucher und dessen Gegenspielerin Erika Price her sind.
Hintergründe und spannende Eindrücke vom großen Star Trek Fan-Event "Destination Star Trek".
Harry will mehr Informationen über die Grauen Aliens sammeln. Doch dadurch bringt er Asta in höchste Gefahr.
D'Arcy mischt sich in Harrys Mission ein. Unterdessen fühlt sich Kate in ihrem eigenen Haus zusehends unwohler.
Harry schließt sich dem Ausflug von Bürgermeister Ben und seiner Familie an. Er hofft, im Yellowstone Nationalpark einige Antworten zu den Grauen Aliens zu erhalten.
Harry verliebt sich in seiner menschlichen Form zum ersten Mal: in Heather, eine Aliendame einer anderen Spezies. Unterdessen machen der Sheriff und Deputy Liv eine entscheidende Entdeckung.
Harry und Heather kommen sich näher und schmieden Zukunftspläne. Sie wollen die Erde gemeinsam verlassen - was die Menschheit der Gnade der Grauen Aliens überlassen würde.
Zwischen den Jaffa und den Ori kommt es zu den ersten Kämpfen. Gerade als Adria die Bewohner eines weiteren Planeten für die Ori gewinnen will, kommt es zu einem schweren Angriff. Nur Adra überlebt. Sie versucht alles, um herauszufinden, welche Waffe diese verheerende Wirkung hat. Auch das SG-1-Team will den Vorfall untersuchen. Dabei geraten Vala und Daniel in Adrias Gefangenschaft.
Vala wird von Trust-Agenten entführt. Diese wollen mit ihrer Hilfe einen alten Schatz finden. Doch durch einen Unfall landet Vala völlig allein in einer rätselhaften Stadt. Zu allem Uberfluss hat sie zudem ihr Gedächtnis verloren. Mitchell und Teal'c machen sich auf die Suche nach ihr. Von Weaver erhoffen sie sich Informationen.
Mitchell schleust sich undercover in die Lucian-Allianz ein. So will er einen Bürgerkrieg zwischen den Allianzen verhindern. Außerdem muss er unter allen Umständen den Aufenthaltsort der entführten "Odysseus" herausfinden, um weitere Mitglieder des SG-1-Teams zu retten.
Mitchell und seine Mannschaft sind weiterhin auf der Suche nach dem heiligen Gral. Mit dessen Hilfe sollen die Ori endlich besiegt werden. Dabei finden sie heraus, dass offenbar noch jemand hinter dem Gral her ist.
Noch immer sucht das SG-1-Team nach dem heiligen Gral, um die Ori endgültig zu bezwingen. Der Kelch wird von einem Drachen bewacht. Nachdem sie den Drachen besiegt haben, werden das SG-1-Team und Ba'al auf einen anderen Planeten transportiert. Dort entdecken sie den Magier Merlin in einer Stasiskammer.
Mitchel, Carter und Teal'c reisen zu einem Planeten, der unter der Herrschaft der Ori steht. Mit einer neuartigen Technologie soll das gesamte Dorf versetzt und so aus der Gewalt der Tyrannen befreit werden. Doch dazu kommt es nicht mehr: Die Ori greifen an, zerstören einen Teil der Technik und verletzen Carter. Vala wird bei dem Angriff von ihrem Ehemann Tomin gefangen genommen.
Sam führt einen Test mit Merlins Gerät durch. Versehentlich transportiert sie sich dadurch in eine Parallelwelt. Landry herrscht dort als Präsident und auch das SG-1-Team hat sich völlig verändert. Sam will nichts lieber, als sofort wieder zurück in ihre Welt. Doch dazu bleibt erst mal keine Zeit, denn in dieser Realität wird die Erde von den Ori bedroht.
Während der Rest des SG-1-Teams beim Kampf mit Adria fliehen konnte, musste Daniel zurückbleiben. Kurze Zeit später erfahren Mitchell und sein Team, dass ein Prior der Ori unterwegs ist. Sie wollen sich mit diesem treffen, doch als dieser ankommt, sind alle fassungslos: Der Prior ist niemand anderer als ihr Freund Daniel.
Dem SG-1-Team gelingt es, drei von Netans Transportschiffen außer Gefecht zu setzen. Wütend setzt Netan ein Kopfgeld auf das Team aus. Unterdessen gibt General Landry seinem Team für einige Tage frei. Doch für Erholung bleibt keine Zeit, denn allen Mitgliedern sind plötzlich Auftragskiller auf den Fersen.
Mitchell und das SG-1-Team finden sich nach der Durchquerung des Stargates inmitten eines archäologischen Museums auf einem fernen Planeten wieder. Unerwartet werden sie von den Bewohnern angegriffen. Diese halten das Kommando für eine Gruppe von Gangstern, die Geiseln nehmen will. Um sich vor den Attacken zu schützen, sieht Mitchell keine andere Chance, als tatsächlich Geiseln zu nehmen.
Bei einem Treffen der Jaffa greifen Terroristen unter der Führung von Arkad an. Dabei werden viele Teilnehmer der Konferenz getötet und Bra'tac schwer verletzt. General Landry sind allerdings die Hände gebunden, er kann die Verbrecher nicht verfolgen. Teal'c schwört Rache und macht sich alleine auf die Jagd nach Arkad.
Roland Emmerichs Sci-Fi-Spektakel mit Kurt Russell: Ein geheimnisvoller Metallring erweist sich als Tor in eine ferne Galaxie. Doch das Expeditionsteam wird nicht mit offenen Armen empfangen.
US-Präsident Abraham Lincoln jagt Blutsauger: Der Macher von "Wanted" mixt Politik und Vampiraction zu einem blutroten Horrorcocktail.
Als sich Mulder unerlaubt Zugang zum Militärstützpunkt Mount Weaver verschaffen will, gerät er in einen Kampf mit einem Supersoldaten, der dabei getötet wird. Mulder wird gefasst, vor einem Militärgericht wegen Mordes angeklagt und zum Tod durch die Giftspritze verurteilt. Direktor Skinner, Doggett und Reyes befreien ihn aus dem Gefängnis und wollen ihn außer Landes schaffen. - Erster Teil des großen Serienfinales.
Der zum Tode verurteilte Mulder wird von Direktor Skinner, Reyes, Doggett aus dem Militärgefängnis befreit. Er soll mit Scully den amerikanischen Kontinent so schnell wie möglich verlassen. Doch Mulder fährt statt dessen nach New Mexico, um die ganze Wahrheit herauszufinden. - Zweiter Teil des großen Serienfinales.
Ein Verschwörungstheoretiker bringt Mulder und Scully wieder zusammen: Web-TV-Produzent Tad O'Malley will mit Hilfe der beiden Ex-FBI-Agenten das Rätsel um eine Alien-Entführung lösen.
Ein Wissenschaftler, der für das Verteidigungsministerium arbeitet, begeht Selbstmord. Die Ermittlungen in dem Fall bringen Mulder und Scully auf die Spur eines geheimen Mutations-Experiments.
Nachdem ein Toter in den Wäldern gefunden wurde, übernehmen Mulder und Scully den Fall. Augenzeugen berichteten, bei dem Täter handele es sich um eine echsenartige Kreatur.
Ein städtischer Mitarbeiter wurde regelrecht in Stücke gerissen. Ein Gemälde am Tatort führt zu einem rachsüchtigen Künstler. Scully erhält schlechte Nachrichten von ihrer Familie.
Mulder und Scully sollen einem Terroristen Informationen entlocken, der im Koma liegt. Scully versucht es mit einem Gehirnscan. Mulder schluckt halluzinogene Pilze, um Zugang zu dem Mann zu erlangen.
Eine tödliche Pandemie bedroht die Menschheit. Während die Infektionen zunehmen, ist Scully offenbar durch die Alien-DNA geschützt. Sie beginnt nach einem Heilmittel zu forschen.
Nachdem Scully schreckliche Visionen erlebt, ist sie überzeugt, dass der Raucher noch lebt und ihrem Sohn William auf den Fersen ist. Mulder versucht den Raucher in South Carolina aufzuspüren.
Der totgeglaubte Richard Langley kontaktiert Mulder und Scully. Wenig später nehmen Attentäter die FBI-Agenten ins Visier. Skinner verschafft den beiden Zugang zu den X-Akten der letzten Jahre.