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Der verrückte Bösewicht Scratch, der Hunde hasst, hält alle Hunde der Stadt gefangen. Seine einzige Forderung ist die Kapitulation des Night Ninja. Aber Leo, April und die Turtles merken, dass mehr dahintersteckt.
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Leo wird noch einmal zum Night Ninja, um gegen den bösen Scratch und seine Floh-Vampir-Mutanten zu kämpfen - nach 15 Jahren Feindschaft. Aber was hat das alles mit Splinter zu tun? Die letzte Schlacht beginnt.