Toby wird Zeuge des Todes von Scotty Furmanek, einem vielversprechenden jungen Martial-Arts-Kämpfer. Der hatte sich für ein Kinderkrankenhaus engagiert, in dem auch Oz aktiv ist. Bei seinen Ermittlungen bekommt Toby schnell den Eindruck, dass der Tod von Scotty Furmanek etwas mit der starken Rivalität zwischen den beiden Ligen zu tun haben muss, in denen die Martial-Arts-Sportler organisiert sind.
Toby und Michelle untersuchen den Mord an einer mysteriösen Frau, die zahlreiche Tätowierungen aufweist. Toby kommt bei seinen Ermittlungen zu der Annahme, dass die Tat mit einem Fall von Spionage und Erpressung in Zusammenhang steht.
Danny (Donnie Wahlberg) und Baez (Marisa Ramirez) eskortieren einen Konvoi voller beschlagnahmter Drogen, die an einem abgelegenen Ort vernichtet werden sollen. Als die Fahrzeuge angegriffen werden, wird Baez schwer verletzt. Danny versucht, das Drogenkartell ausfindig zu machen, das für den Überfall verantwortlich war. Unterdessen muss Frank (Tom Selleck) persönliche und politische Hindernisse umschiffen, als ein bislang vorbildlicher Lieutenant durch seine Handlungen eine Kontroverse um das NYPD auslöst...
Ein Offizier der Küstenwache wird auf einem Schiff erschossen. Die Crew ist bereits von Bord gegangen. Als Gibbs (Mark Harmon) und seine Leute zusammen mit Agent Borin (Diane Neal) das Schiff untersuchen, hören sie Geräusche unter Deck. Was sie dort erwartet, schockiert alle: Eine libanesische Familie ist in einem der Räume eingeschlossen. Sie behaupten, dass sie politische Flüchtlinge seien, die um Asyl bitten wollen. Doch schnell stellt sich heraus, dass sie etwas ganz anderes im Schilde führen...
Die Leiche eines Mannes wird gefunden, der zunächst starkes Ecstasy konsumiert und dann so viel Wasser getrunken hat, dass er buchstäblich ertrunken ist. Die Ermittlungen ergeben, dass er das Ecstasy nicht freiwillig genommen hat. Kurz darauf findet das Team ein zweites Opfer, das auf die gleiche Weise umgebracht wurde. Beide Männer hatten Verbindungen zur Navy und haben ihre Frauen ständig betrogen. Hat sie ihre Beziehungsunfähigkeit das Leben gekostet?
Diane Sterling (Melinda McGraw), Ex-Frau von Gibbs und Fornell (Joe Spano), bittet die beiden um Hilfe, denn ihr aktueller Ehemann ist verschwunden. Es handelt sich um Victor Sterling (Tom Gallop), einen Beamten der Homeland Security. Gibbs (Mark Harmon) und Fornell sind zunächst wenig begeistert, doch dann werden in dem Drive-in, in dem Victor am Abend seines Verschwindens gesehen wurde, zwei Leichen gefunden. Die Ermittlungen stagnieren und es entsteht der Verdacht, dass Victor seine Entführung nur vorgetäuscht hat...
Als der New Yorker Undecover-Cop Reggie Cole (Sean Combs), der seit zwei Jahren verdeckt gegen Mafiaboss Jimmy Cannon (Keith David) ermittelt, seine Frau und seinen Sohn Kevin auf Hawaii besucht, scheint sein Cover aufgeflogen zu sein: Er wird mit seiner Familie nachts angegriffen. Nur Reggie, ein FBI-Agent und Kevin (Kwesi Boakye) überleben. Schon als Steve (Alex O'Loughlin) und Danny (Scott Caan) Reggie im Krankenhaus befragen, wird klar, dass Reggie sich von nichts und niemandem davon abhalten lässt, den Mörder seiner Frau zu finden.
Der berühmte Fotograf Renny Sinclair (Rick Springfield), der gerade auf Hawaii Bademoden fotografiert, verbrennt bei lebendigem Leib in seinem Wohnwagen. Steve (Alex O'Loughlin) und sein Team finden schnell heraus, dass Brandstiftung die Ursache für seinen Tod war. Rennys Freundin, das Model Alana (Serinda Swan), hat ihre Kollegin Jordan (Angela Lindvall) im Verdacht, denn die war noch bis vor sechs Monaten mit Renny zusammen.
Five-O stürmt mit Unterstützung des HPD Wo Fats Haus _ doch der ist nicht da. Stattdessen findet Steve (Alex O'Loughlin) dort Sang Min (Will Yun Lee) vor, der seinerseits Wo Fat (Mark Dacascos) mit einer Bombenfalle erwartet hatte. Sang Min kann fliehen, und bei seiner Verfolgungsjagd gerät Danny (Scott Caan) zufällig in Kontakt mit einer Biowaffe, woraufhin er sofort ins Krankenhaus muss.
Ein neuer Fall bringt das NCIS-Team auf die Spur des letzten Überlebenden einer mittlerweile aufgelösten Terrororganisation, der im Verhör dringend benötige Informationen preisgeben soll. Kensi (Daniela Ruah) und Deeks (Eric Christian Olsen) sind gezwungen, sich im Zuge der Ermittlungen auf eine ausgedehnte Wanderung durch die Wälder zu begeben...
Sam (LL Cool J) will einem Freund, einem afghanischen Stammesältesten, zur Seite stehen, dessen Neffe unter ungeklärten Umständen verschwunden ist. Der Afghane hatte Sam einst beigestanden, als dieser vor Jahren im Einsatz verwundet wurde. Callen (Chris O'Donnell) befürchtet jedoch, dass Sam sich aufgrund seiner Vorgeschichte zu sehr in die Ermittlungen hineinsteigern könnte...
Ein Diplomat wird ermordet in einem Hotelzimmer aufgefunden. Kurz darauf kontaktiert der britische Geheimdienst den IIB und bittet um Mithilfe. Vor allem ist man auf der Suche nach dem Mobiltelefon des Opfers, das spurlos verschwunden ist. Ihre Ermittlungen führen Toby und Michelle zu einer Dating-Agentur, die über das Internet operiert.
Toby und Michelle sind einem Mörder und Menschenhändler auf der Spur. Entscheidende Hilfe erhalten die beiden bei ihren Ermittlungen von einer Hochstaplerin. Sie wurde vor kurzem vom IIB festgenommen und bietet ihre Unterstützung bei der Suche nach dem Killer an, mit dem sie eine mysteriöse Geschichte zu verbinden scheint.
Eine Polizistin, die gegen ihren ehemaligen Streifenpartner ausgesagt hat, wird von den übrigen Cops als Verräterin gebrandmarkt und gemieden. Jamie (Will Estes) beweist Zivilcourage und meldet sich freiwillig, eine Woche lang mit ihr Streife zu fahren. Das trägt ihm allerdings den Zorn seines eigenen Partners und seiner übrigen Kollegen ein. Erin (Bridget Moynahan) und Danny (Donnie Wahlberg) wiederum geraten aneinander, als ein vermeintlich erledigter Fall in einem Totschlag endet...
Wo Fat (Mark Dacascos) ist zurück und sein Masterplan gelingt: Laura Hills (Kelly Hu), die Assistentin der Gouverneurin, kommt durch eine Autobombe um, und Steve McGarrett (Alex O'Loughlin) wird des Mordes an ihr beschuldigt. Er flieht kurz vor seiner Verhaftung und ermittelt auf eigene Faust. Als sich herausstellt, dass Laura Hills ihm die Beweise aus dem Werkzeugkasten seines Vaters geschickt hatte, muss Steve entsetzt feststellen, dass Gouverneurin Jameson (Jean Smart) hinter dem Mord an Laura steckt.
Als Danny (Scott Caan) Steve hinter Gittern besucht, bringt er einen weiteren Gast mit: Commander Joe White (Terry O'Quinn), Steves ehemaligen Militärausbilder. White will Danny, Chin (Daniel Dae Kim), Kono (Grace Park) und Jenna Kaye (Larisa Oleynik) dabei helfen, Steve aus dem Gefängnis zu holen. Steve (Alex O'Loughlin) wird unterdessen von seinem Widersacher Hesse (James Marsters) niedergestochen und nutzt die Fahrt im Krankenwagen zur Flucht. Es gelingt ihm tatsächlich, sich mit White zu treffen, der alle Hebel in Bewegung setzt, um Steves Unschuld zu beweisen.
Mit dem neuen Gouverneur Denning (Richard T. Jones) ist nicht gut Kirschen essen: Er macht Steve (Alex O'Loughlin) unmissverständlich klar, dass er streng auf die Einhaltung seiner Regeln achten wird _ und dazu gehört auch, dass er Steves Truppe ein neues Teammitglied zuweist: Lori Weston (Lauren German), die zuvor als Profilerin fürs FBI und Homeland Security gearbeitet hat. Ihre Fähigkeiten kann Lori schon bald unter Beweis stellen: Die 15-jährige Jen _ frisch gekürte Paddleboard-Weltmeisterin _ wurde gekidnappt.
Ein Flugzeug, das gefallene Soldaten zurück in die USA bringen sollte, stürzt ab. Ducky (David McCallum) stellt fest, dass einer der Särge leer war _ nämlich der von First Lieutenant Gabriela Flores (Sofia Pernas). Sie war Mitglied einer Spezialeinheit in Afghanistan, die versuchte, Mädchen Schulbildung zu vermitteln. Bei einem Anschlag soll sie umgekommen sein. Satellitenbilder zeigen aber, dass Gabriela mit zwei Kindern fliehen konnte. Gibbs (Mark Harmon) erhält von oberster Stelle den Auftrag, sie vor Ort zu suchen.
Gibbs (Mark Harmon) und Ziva (Cote De Pablo) fliegen nach Afghanistan, nachdem sie eindeutige Hinweise erhalten haben, dass Lieutenant Gabriela Flores (Sofia Pernas) noch am Leben ist. Sie wurde, wie sich herausstellt, von islamischen Fanatikern entführt, weil sie am Aufbau einer Mädchenschule beteiligt war. Auf die Schule wurde bereits ein Anschlag verübt, und die Ermittler können die Drahtzieherin festnehmen. Was keiner ahnt: Ihre verbrecherischen Wurzeln reichen bis in die USA, und ein weiteres Attentat steht kurz bevor!
Tonys Vater (Robert Wagner) wird schlafend in seinem Mietwagen aufgefunden. Im Kofferraum liegt die Leiche von Lieutenant Massey (Tom Schanley). Tony Senior gerät unter Mordverdacht, alle Indizien sprechen gegen ihn. Als schließlich die Mordwaffe, eine Weinflasche, gefunden wird, scheint der Fall gelöst _ der alte Mann kann sich jedoch an nichts erinnern. Es stellt sich heraus, dass er gemeinsam mit Massey an einem Projekt gearbeitet hat und es zu einem heftigen Streit kam, der auf Video festgehalten wurde.
Nach dem Mord an einem Boss der russischen Mafia ermitteln die US-Behörden auf Hochtouren: Sams Ehefrau schlüpft erneut für die CIA in ihre Undercover-Identität, um die Hintergründe der Tat zu klären _ sehr zu Sams Missfallen, der um ihre Sicherheit besorgt ist. Wie sich herausstellt, ist der Waffenhändler Sidorov in den Fall verwickelt, der bereits mehrere Nuklearsprengköpfe gestohlen hat...
Eine Waffe, die bei einem die nationale Sicherheit gefährdenden Verbrechen in L.A. zum Einsatz kam, taucht bei einem Mordfall in Idaho erneut auf. Callen (Chris O'Donnell) und Sam (LL Cool J) begeben sich sofort dorthin, um die frische Spur zu verfolgen. Dort schließen sie sich dem NCIS-Team Red an, einer mobilen Agentengruppe, die von Tatort zu Tatort reist.
Gerade als sich Ray Donovans Leben wieder zu normalisieren beginnt, erfährt der Chef des FBI Los Angeles, Ed Cochran, dass Ray und Mickey in den Mord an Sully Sullivan verwickelt waren. Er verlangt, dass Ray Mickey aus Mexiko zurückbringt, der dort gerade einen Kampf für Rays Halbbruder Daryll organisiert. Außerdem muss Ray seinem Klienten Deonte aus einer heiklen Situation zwischen seiner Frau und einer "American Idol"-Finalistin heraushelfen. Bunchy ist nervös wegen seines Vorstellungsgesprächs, und Terry kann nicht aufhören, an seine Ex-Freundin zu denken.
Ray zwingt Mickey, nach Los Angeles zurückzukommen, und bringt ihn zu Ed Cochran. Der lässt Mickey auf Bewährung frei und hält dann eine Pressekonferenz ab, in der er die volle Verantwortung für das Auffinden und Erschießen von Sully Sullivan übernimmt. Doch die Bostoner Reporterin Kate McPherson nimmt dem FBI die Geschichte nicht ab. In dem verzweifelten Versuch, Mickey unter Kontrolle zu bringen, besticht Ray einen Bewährungshelfer, damit er Mickeys Fall übernimmt. Kate beginnt, Sullys Tod zu untersuchen, und beschließt, nach Los Angeles zu kommen.
Chloe Foster, die Tochter des britischen Botschafters in Thailand, wird am Vorabend eines historischen Gipfeltreffens entführt. Scott (Sullivan Stapleton) und Stonebridge (Philip Winchester) sind den Kidnappern schnell auf der Spur und finden heraus, dass die Bande von einem Auswanderer namens Ray McQueen angeführt wird. Ein Rennen gegen die Zeit beginnt, bei dem das Team die skrupellosen Verbrecher durch Thailands Unterwelt jagt. Als jedoch alle Bemühungen ins Leere laufen, entscheidet sich Botschafter Foster, selbst in die Verhandlungen einzugreifen _ ein möglicherweise verhängnisvoller Fehler.
Nach dem Mord an einem Boss der russischen Mafia ermitteln die US-Behörden auf Hochtouren: Sams Ehefrau schlüpft erneut für die CIA in ihre Undercover-Identität, um die Hintergründe der Tat zu klären _ sehr zu Sams Missfallen, der um ihre Sicherheit besorgt ist. Wie sich herausstellt, ist der Waffenhändler Sidorov in den Fall verwickelt, der bereits mehrere Nuklearsprengköpfe gestohlen hat...
Eine Waffe, die bei einem die nationale Sicherheit gefährdenden Verbrechen in L.A. zum Einsatz kam, taucht bei einem Mordfall in Idaho erneut auf. Callen (Chris O'Donnell) und Sam (LL Cool J) begeben sich sofort dorthin, um die frische Spur zu verfolgen. Dort schließen sie sich dem NCIS-Team Red an, einer mobilen Agentengruppe, die von Tatort zu Tatort reist.
Gerade als sich Ray Donovans Leben wieder zu normalisieren beginnt, erfährt der Chef des FBI Los Angeles, Ed Cochran, dass Ray und Mickey in den Mord an Sully Sullivan verwickelt waren. Er verlangt, dass Ray Mickey aus Mexiko zurückbringt, der dort gerade einen Kampf für Rays Halbbruder Daryll organisiert. Außerdem muss Ray seinem Klienten Deonte aus einer heiklen Situation zwischen seiner Frau und einer "American Idol"-Finalistin heraushelfen. Bunchy ist nervös wegen seines Vorstellungsgesprächs, und Terry kann nicht aufhören, an seine Ex-Freundin zu denken.
Ray zwingt Mickey, nach Los Angeles zurückzukommen, und bringt ihn zu Ed Cochran. Der lässt Mickey auf Bewährung frei und hält dann eine Pressekonferenz ab, in der er die volle Verantwortung für das Auffinden und Erschießen von Sully Sullivan übernimmt. Doch die Bostoner Reporterin Kate McPherson nimmt dem FBI die Geschichte nicht ab. In dem verzweifelten Versuch, Mickey unter Kontrolle zu bringen, besticht Ray einen Bewährungshelfer, damit er Mickeys Fall übernimmt. Kate beginnt, Sullys Tod zu untersuchen, und beschließt, nach Los Angeles zu kommen.
Chloe Foster, die Tochter des britischen Botschafters in Thailand, wird am Vorabend eines historischen Gipfeltreffens entführt. Scott (Sullivan Stapleton) und Stonebridge (Philip Winchester) sind den Kidnappern schnell auf der Spur und finden heraus, dass die Bande von einem Auswanderer namens Ray McQueen angeführt wird. Ein Rennen gegen die Zeit beginnt, bei dem das Team die skrupellosen Verbrecher durch Thailands Unterwelt jagt. Als jedoch alle Bemühungen ins Leere laufen, entscheidet sich Botschafter Foster, selbst in die Verhandlungen einzugreifen _ ein möglicherweise verhängnisvoller Fehler.
Jen und Ted haben ein Blind Date und stellen fest, dass sie sich unter ähnlichen Umständen schon einmal getroffen haben, ohne dass es zwischen ihnen gefunkt hat. Jetzt wollen beide herausfinden, was damals schiefgelaufen ist. Unterdessen schleppt Barney Marshall in einen Strip-Club, um ihn von seinem permanent schlechten Gewissen zu heilen. Dumm ist nur, dass die Stripperin ausgerechnet Lily zum Verwechseln ähnlich aussieht.
Weil Robin glaubt, dass Barney sie betrügt, schnüffelt sie in seinen Sachen herum und wird prompt fündig. Barney hat eine Art Dossier über sie angelegt, das all ihre Eigenarten und kleinen Fehler enthält. Zusammen mit Lily versucht sie, der Sache auf den Grund zu gehen. Dabei stellt sich heraus, dass Ted seinem Freund Barney offensichtlich mit Insiderinformationen über Robin hilfreich zur Seite steht.
Ein Diplomat wird ermordet in einem Hotelzimmer aufgefunden. Kurz darauf kontaktiert der britische Geheimdienst den IIB und bittet um Mithilfe. Vor allem ist man auf der Suche nach dem Mobiltelefon des Opfers, das spurlos verschwunden ist. Ihre Ermittlungen führen Toby und Michelle zu einer Dating-Agentur, die über das Internet operiert.