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Eben war es Mammut Manny, dem Säbelzahntiger mit Herz, Diego, und dem Tollpatsch vom Dienst, Sid, noch kuschelig kalt, da wird es ihnen auch schon mächtig warm unter dem Pelz. Grund dafür sind steigende Temperaturen, die das Ende der Eiszeit einläuten und mit schmelzenden Gletschern Überschwemmungen androhen. Aber auch an anderen Fronten drohen unfreiwillige Abenteuer: Sei es, dass Manny, dem vermeintlich letzten seiner Art, unvermittelt mit Ellie ein Mammut-Weibchen gegenüber steht, die sich ausgerechnet für ein Opossum hält. Oder sei es, dass Sid von einem Volk von Mini-Faultieren für eine Art Gott gehalten wird. Und darüber hinaus hadert Scrat wieder einmal mit seiner heiss geliebten Eichel.
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Natürlich versucht Scrat noch immer die schwer fassbare Nuss zu schnappen (und findet dabei vielleicht die grosse Liebe), Manni und Ellie erwarten die Geburt ihres Mini-Mammut, Sid, das Faultier, bekommt Ärger, als er sich mit gefundenen Dino-Eiern seine eigene Ersatzfamilie schaffen will und Diego der Säbelzahntiger fürchtet, dass er vielleicht zu "soft" werden könnte, wenn er immer mit seinen Kumpels rumhängt. Bei dem Versuch, Sid aus einer unglücklichen Situation zu befreien, gerät die Truppe in eine mysteriöse Unterwelt tief unter dem Eis, in der sie einige überraschende Begegnungen mit Dinosauriern haben. Sie müssen sich mit einer Flora und Fauna auseinander setzen, die Amok zu laufen scheint und schliesslich treffen sie auf ein unbarmherziges, einäugiges Wiesel namens Buck, das den Dinosauriern ewige Rache geschworen hat und sie mit wenig Erfolg jagt.