Die junge Ellie hat Furchtbares erlebt. Ihr Vater und ihre Schwester wurden vor kurzer Zeit ermordet. Und jetzt hat jemand ihre beiden Freundinnen Dee und Morgan entführt. Als Morgan ermordet aufgefunden wird, ist Ellie fest entschlossen, das Leben ihrer Freundin Dee zu retten. Weil die Polizei mit ihren Ermittlungen auf der Stelle tritt, beginnt Ellie, auf eigene Faust nach Dee zu suchen. Dabei gerät sie schon bald in Lebensgefahr.
Brett Huston , der Chef des Nachrichtensprecher-Teams eines Fernsehsenders, war nicht sehr beliebt. Nachdem er ermordet wurde, hält sich die Trauer daher in Grenzen. Verdächtig sind viele: Am Sport-Kollegen Chuck Gilmore versuchte sich Huston mit Rufmord, der Wettermann Gary Slate wurde gedemütigt, andere wollten einfach nur Hustons Job. Verhaftet wird jedoch die Moderatorin Gillian Pope , mit deren Waffe Brett erschossen wurde. Perry Mason hält sie für unschuldig und übernimmt die Verteidigung.
Bull streckt das Geld für eine Sammelklage von Tausenden von Menschen gegen die unlauteren Machenschaften einer Bank vor. Dabei ist das Risiko hoch, dass seine Firma bankrott macht, sollte der Prozess verloren gehen. Auch Benny könnte dem Fall schaden, da er sich von einer Klientin stark angezogen fühlt und dadurch abgelenkt ist. Außerdem macht er sich Sorgen wegen eines Geheimnisses, das er vor Bull hat.
Die enge Beziehung von Dr. Jason Bull und Chunk Palmer wird auf eine harte Probe gestellt, als Bull sich für den Hauptverdächtigen im Mordfall Nella Wester einsetzt. Das ehemalige Model war inzwischen selbst Designerin und Chunks Mentorin. Nella wurde während ihrer eigenen Modenschau ermordet.
Am Abend vor Thanksgiving trifft DiNozzo , Bishop und deren Ehemann Jake während eines starken Schneetreibens zufällig auf dem Dulles-International Airport. Tony wartet dort auf die Ankunft seines Vaters, das Ehepaar möchte verreisen. Als Gibbs ihnen telefonisch mitteilt, dass es für den Feiertag Hinweise auf eine erhöhte Terrorgefahr auf den Flughäfen der Region gibt, halten sie die Augen offen. Tatsächlich fällt Bishop ein Air Marshall auf, der sich ungewöhnlich verhält.
Durch einen Hackerangriff wurde in ganz Washington D.C. das Internet lahmgelegt. Die Behörden haben die Kontrolle über die Situation verloren und sind in Sorge, dass geheime Informationen, die auch die nationale Sicherheit betreffen könnten, veröffentlicht werden. Um dem Hacker das Handwerk legen zu können, holt man die verurteilten Cyber-Kriminellen Kevin Hussein , Heidi Partridge und Henry Khan zur Unterstützung aus dem Gefängnis und unterstellt sie McGee .
Eine Art Massaker, bei dem sich fünf Menschen offenbar gegenseitig umgebracht haben, beschäftigt Gibbs und sein Team. Das Szenario weist eindeutige Parallelen zu alten Fällen auf, mit denen Gibbs zu tun hatte. Für den wird die Sache noch komplizierter, als seine Exfrauen Diane und Rebecca am Tatort auftauchen und dem NCIS-Teamleiter das Leben schwer machen. Doch bald stellt sich heraus, dass echte Gefahr von ganz anderer Seite droht.
Nachdem die in Syrien von Islamisten entführte US-Bürgerin Sarah Goode nach einjähriger Gefangenschaft durch eine Rettungsaktion befreit werden konnte, wird sie in Washington von Gibbs und seinem Team befragt. Dabei stellt sich heraus, dass einer der Entführer ein gebürtiger Amerikaner war, der inzwischen wieder in den Vereinigten Staaten, ja sogar in Washington D.C. ist. Gibbs und FBI Agent Fornell sind ihm auf den Fersen. Währenddessen fragen sich McGee und Bishop , was mit Tony los ist.
Ein Navy Lieutenant, der offen mit seiner Homosexualität umging, und dem für seinen mutigen Einsatz im Afghanistan-Krieg die "Medal of Honor" verliehen werden sollte, wird umgebracht. Gibbs und sein Team übernehmen die Ermittlungen und merken schnell, wie groß die Ressentiments gegen Homosexuelle in der Navy sind. Derweil setzen bei Breena die Wehen ein und sie bringt eine gesunde Tochter namens Victoria Elizabeth Palmer zur Welt.
DiNozzo kehrt gemeinsam mit Bishop an seine frühere Schule, die Remington Military Academy, zurück, um im Mordfall eines anderen ehemaligen Schülers zu ermitteln. Bei dem Toten wurde das Foto von Christine Sanders gefunden, die ebenso eine Schülerin der Academy war. Außerhalb der Arbeitszeit laden Bishop und ihr Mann Jake , Gibbs und das Team zum Essen ein.
Ein Schiff der Navy, auf dem eine Konferenz zum Thema internationaler Terrorismus stattfindet, wird Ziel eines Anschlags. Nachdem sich herausstellt, dass die detonierte Granate russischer Herkunft war, vermutet das Team, dass hinter der Sache womöglich Gibbs' Erzfeind Mishnev stecken könnte. Währenddessen muss sich Gibbs um FBI-Agent Fornell kümmern. Der ist nach dem Tod seiner Frau schwer traumatisiert und greift immer häufiger zur Flasche. Als Gibbs versucht, ihn davon wegzubringen, greift Fornell zu drastischen Maßnahmen.
Nachdem Hotch im letzten Fall stark verwundet wurde, kehrt er einen Monat später in den Dienst zurück. Seine Kollegen sind allerdings um seinen seelischen Zustand besorgt, weil die Folgen des Traumas schwer einzuschätzen sind. Der nächste Fall führt das Team nach Louisville, wo ein Amokläufer um sich greift. Dieser hat schon seit einer Weile seine Antidepressiva nicht mehr eingenommen, und auch sein eigener Arzt zählt zu seinen Opfern.
Das Team der BAU wird nach Long Island gerufen, wo bereits das dritte Opfer eines Serienmörders aufgefunden wurde. Jedes Opfer wurde gefesselt und hat Einschüsse am Kopf und Herz, außerdem fehlen den Männern Körperteile. Je tiefer sich das Team in den Fall einarbeitet, desto klarer werden die Beziehungen, in denen die drei Opfer zueinander stehen. Das Team vermutet einen Auftragsmörder hinter den Taten, und der hat bereits sein nächstes Opfer im Visier.
In einer gutbürgerlichen Wohngegend im Südwesten von Washington D.C. ist die Kriminalitätsrate bedeutend gestiegen. Zwei Paare wurden nach einem Hauseinbruch totgeschlagen aufgefunden, jedoch wurde beide Male nichts gestohlen. Das Team der BAU sucht nach möglichen Motiven und Tätern, dieser Art von Vandalismus, der von purem Nihilismus und aggressiver Gewalt beherrscht zu sein scheint.
Ein sadistischer Sexualtäter treibt in New Mexico sein Unwesen. Seine Opfer sind blond und im Teenageralter, und meist schon seit längerer Zeit vermisst - bis sie dann tot wieder auftauchen. Auffällig ist, dass die Opfer, tot aufgefunden, in einem besseren gesundheitlichen Zustand zu sein scheinen, als kurz vor ihrem Verschwinden. Außerdem scheinen alle kurz vor ihrem Tod ein Kind gekriegt zu haben. Das höchste Ziel der BAU ist es nun, möglichst schnell die Babys zu finden, um Schlimmeres zu verhindern.
Das BAU-Team wird nach Oklahoma City gerufen, um die Ermittlungen in einem besonders grausamen Fall aufzunehmen. Ein Serienmörder treibt sein Unwesen, doch damit nicht genug: Er entfernt seinen Opfern die Augen und behält sie für sich als Trophäen.
Das BAU-Team wird nach Los Angeles beordert, um eine Mordserie aufzuklären. Die Ermittlungen führen die Profiler zu einem Gothic Rock Star. Der kann, wie es scheint, keine klaren Grenzen mehr zwischen seinem Bühnencharakter und seinem realen Leben ziehen.
Hampton, Virginia: Die Ermittlungen in einer Mordserie, bei der ganze Familien ausgelöscht werden, führen das Profiler-Team in das Red Onion Supermax Gefängnis. Dort erhoffen sie sich von einem ihrer ärgsten Widersacher, dem inhaftierten Killer "The Fox", Hinweise zur Aufklärung der Morde. Doch der übermittelt Agent Hotchner eine unheilvolle Botschaft.
Der Vergewaltiger Foyet ist nach Washington zurückgekehrt. Das BAU-Team setzt alle Kräfte frei, um ihn zu finden. Die Zeit drängt, denn der Verbrecher hat es auf die Familie von Agent Hotchner abgesehen.
Vor einem Lokal wird der Jockey Oscar Salazar ermordet aufgefunden. Die Ermittler Fontana und Falco vermuten, den Täter auf Oscars Arbeitsplatz finden zu können - einer Pferderennbahn außerhalb New Yorks. Oscars Aufgabe bestand darin, die Pferde morgens warm zu reiten. In einem der Pferde entdeckte er großes Potential und erforschte daraufhin den Stammbaum des Pferdes. Kostet seine Neugier ihm das Leben?
Für einen Feuerwehrmann, der während eines Einsatzes vom Dach sprang, kommt jede Hilfe zu spät. Fontana und Falco erfahren, dass er kurz zuvor mit einem Revolver Kaliber 38 am Bein verletzt wurde - ein höchst seltenes Exemplar. Vor neun Jahren wurde damit ein Mann namens Justin Lennard erschossen. Als Lennards damalige Freundin verhört wird, kommt ihr Bruder Elwin aufs Revier und gesteht, Lennard damals ermordet und den Revolver auf dem Dach eines benachbarten Hauses versteckt zu haben. Am Tag des Gerichtstermins, zieht er das Geständnis allerdings zurück.
Bei einem Zugunglück sterben zwölf Menschen. Schuld daran ist ein Geländewagen, der auf den Schienen abgestellt wurde, um den Zug zum Entgleisen zu bringen. Fontana und Falco verdächtigen Davey Buckley. Der Mann legt sogar ein Geständnis ab, doch Rechtsanwalt Fallon plädiert für die Schuldunfähigkeit seines Mandanten, da er diesen für geistig unzurechnungsfähig hält. Als Buckley bewusst wird, dass er dann in der Psychiatrie landen würde, entlässt er Fallon als Anwalt und behauptet die Tat als Selbstmord geplant zu haben.
Ein fünfjähriges Mädchen wird am helllichten Tag mit dem Auto ihrer Mutter entführt. Fontana und Green stoßen auf einen Verdächtigen, der jedoch den Weg zu dem Kind nur gegen seine Straffreiheit verraten will. Die Anwälte McCoy und Borgia hecken daher einen Deal aus. Dieser hat allerdings rechtliche und politische Konsequenzen .
Bei der Leiche eines erschossenen Mannes finden Green und Fontana die Visitenkarte von Detective Olivia Benson von der Special Victims Unit. Gemeinsam mit den Kollegen stoßen sie auf allerlei krumme Geschäfte und Verbündete des Toten. Doch die verdächtigen Betrüger versuchen mit allen Mitteln, die Anwälte auszutricksen .
Der Milliardär Richard Elia beauftragt Walter und sein Team, seine Tochter zu befreien. Die arbeitet als Journalistin und wurde von einem mexikanischen Drogenkartell entführt. Das Team droht bei seinen Ermittlungen in eine Falle zu tappen. Zu allem Überfluss herrscht in der "Scorpion"-Gruppe schlechte Stimmung, seit Walter ein Radiointerview gegeben und dabei seine Mitstreiter nicht einmal erwähnt hat.
Die seit langem schwelenden Grenzkonflikte zwischen Weißrussland, Litauen und Lettland drohen zu eskalieren. Um einen Krieg zu vermeiden, der sich zum Dritten Weltkrieg ausweiten könnte, treffen sich die Staatschefs der Länder in den USA zu Friedensgesprächen. Das "Scorpion"-Team sorgt dafür, dass das Treffen geheim bleibt. Als einer der Gesprächsteilnehmer vergiftet wird, drohen die Verhandlungen zu platzen, und Walter und seine Leute müssen eingreifen.
Ein Toter im Hafen erweist sich als der ehemalige Navy-Angehörige und spätere IT-Unternehmer Larry Overson. Das Team verdächtigt dessen Ex-Kollegen Mark Powell (Kaj-Eric Eriksen) der Tat. Powell gibt zu, gemeinsam mit Overson das illegal arbeitende Datensammelprogramm "Daemon" entwickelt zu haben, will aber den Mord nicht begangen haben. Callen und Sam lassen sich daraufhin in das Softwareunternehmen einschleusen.
Gerade als Kensi und Deeks bekanntgeben, dass sie planen zusammenzuziehen, hat Hetty einen delikaten Auftrag für die beiden: Sie sollen Kensis Ex-Freund, den aus Afghanistan angereisten Jack Simon , beschützen. Der trifft sich in Los Angeles mit dem Zollbeamten Sy Riggs , der im Verdacht steht, Geschäfte mit seinem im Kriegsgebiet erworbenen Wissen über antike Kunstgegenstände zu machen.
Als das Team erfährt, dass Anna Kolchek Anatoli Kirkin entführt hat, um über ihn herauszufinden, wo sich ihr Vater, der angeblich tote Arkady Kolchek befindet, erklärt es sich bereit, ihr zu helfen. Gemeinsam mit Anna schleusen sich einige Mitglieder des Team während einer Gala-Veranstaltung in die russische Botschaft ein, um Zugang zu deren Zentralcomputer zu bekommen, auf dem sie Hinweise auf Arkadys Aufenthaltsort vermuten.
Anna Kolchek will zusammen mit Sam und Callen ihren Vater Arkady und den CIA-Mann Sharov aus einem russischen Gefängnis entführen und in die USA zurückholen. Während eines Gefangenentransports gelingt es tatsächlich, die beiden zu befreien. Um heil aus Russland herauszukommen, sind sie auf die Hilfe von Garrison angewiesen.
Bull streckt das Geld für eine Sammelklage von Tausenden von Menschen gegen die unlauteren Machenschaften einer Bank vor. Dabei ist das Risiko hoch, dass seine Firma bankrott macht, sollte der Prozess verloren gehen. Auch Benny könnte dem Fall schaden, da er sich von einer Klientin stark angezogen fühlt und dadurch abgelenkt ist. Außerdem macht er sich Sorgen wegen eines Geheimnisses, das er vor Bull hat.