Ein berüchtigter Killer ist plötzlich zurück, und Carrie (Poppy Montgomery) und Al (Dylan Walsh) bekommen es mit einer terroristischen Schläferzelle zu tun.
Ein Mord auf Carries (Poppy Montgomery) Klassentreffen zeigt Verbindungen zu einem ungelösten Fahrerflucht-Fall, bei dem vor fast 25 Jahren ein Klassenkamerad starb.
Keef lässt alles stehen und liegen, um Clovis zu helfen, mit einem Überraschungsgast fertig zu werden. Während das Bay Arean im Niedergang begriffen ist, kämpft Ayana darum, einen neuen Platz zum Leben zu finden.
Am Anfang der dritten Staffel jagt das FBI Liz wegen des Mordes an einem Generalstaatsanwalt. Außerdem: Red und Liz versuchen mit der Hilfe eines Blacklisters, genannt Troll Farmer, aus der Stadt zu fliehen, und Dembe wird in eine gefährliche Lage gebracht.
Liz entkommt in die russische Botschaft, als sie und Red vom FBI in die Enge getrieben werden. Liz kann niemandem außer Red vertrauen, der einen Anwalt namens Marvin Gerard mobilisiert, um ihnen zu helfen, eine schwierige Geiselnahme zu vermeiden. Zwischenzeitlich versucht das FBI, Cooper aus der Task Force zu drängen.
Red und Liz begeben sich in ihrem Bemühen, die Cabal zu Fall zu bringen und Liz zu entlasten, in den Mittleren Westen. Zwischenzeitlich entdecken Ressler, Samar und Aram etwas, das zu einer globalen Nahrungsmittelkrise werden könnte.
Der Dschinn lässt Rachephantasien wahr werden - sofern man zahlungskräftig ist. Seinen Erzfeind bei lebendigem Leib verspeisen? Seine Firma in den Ruin treiben oder übernehmen? Alles lässt sich arrangieren. Dass der Dschinn eine Frau ist, ist nur die erste Überraschung.
Auf Agent Keen wird eine Belohnung ausgesetzt, unzählige zwielichtige Auftragsmörder tauchen auf und Red versucht, sie zu beschützen.
Milliardär Sir Crispin Crandall, Gründer von Crandall Cryonics, wohnt über den Wolken - in seinem Airbus A-380. Gelandet wird nur, um seine kostbare Fracht an Bord zu nehmen: Crandall baut eine fliegenden Arche für die genialsten Köpfe unserer Zeit. Er lässt Koryphäen aller großen Wissenschaftsfelder (jeweils Mann und Frau) entführen, um sie für die Zukunft zu konservieren.
Das FBI rückt Red und Liz immer näher. Plötzlich werden die beiden voneinander getrennt und Red wird einer gefährlichen Situation ausgesetzt. Werden sie es schaffen voneinander losgelöst die richtigen Entscheidungen zu treffen?
Am Morgen nach Samars und Resslers Schäferstündchen sind Liz und Red im ländlichen West Virginia unterwegs, als Red an einer Tankstelle von den selbsternannten "Kings of the Highway" entführt wird, einer Bande Wegelagerer, die Fremde ausraubt und umbringt.
Als Aram darum kämpft, die gefangene Liz zu schützen, tun sich Tom und Ressler zusammen, um Karakurt von der Cabal fernzuhalten.
Während Ciro in Spanien weilt, baut Imma ihre Macht im Clan weiter aus. Ciro hält nicht viel von ihrem Führungsstil und versucht, sich nach seiner Rückkehr nach Neapel auf eigene Faust in der Organisation zu profilieren. Doch dann gibt Imma ihm einen Auftrag, der sich als perfide Falle erweist.
Ciro bleibt keine andere Wahl: Um seine Position im Clan zu sichern, muss er wohl oder übel mit der machthungrigen Imma kooperieren. Unterdessen flammt unter den neapolitanischen Mafia-Clans ein neuer Konflikt auf, der Imma auf ihre erste Bewährungsprobe stellt.
Nach seiner Rückkehr aus Honduras ist Genny wie verwandelt: Aus dem verwöhnten Paten-Söhnchen ist ein selbstbewusster Mann geworden, der auf seinen Führungsanspruch im Clan pocht.
Mithilfe des von ihm eingesetzten Bürgermeisters kommt Genny zu neuer Macht im Clan. Doch Ciro fällt ihm in den Rücken: Er ordnet einen Mord an, der Genny und den Savastano-Clan in eine neue Auseinandersetzung mit den Contes stürzen könnte.
Salvatore Conte kehrt nach Neapel zurück, um die Ermordung von Tonino Russo zu rächen. Genny versucht indes zu beweisen, dass er nichts mit dem Mord zu tun hat und begibt sich auf die Suche nach dem Killer, Teenager Danielino.
Die Fehde mit den Becks erreicht einen brutalen Höhepunkt. Kayce sucht seinen entführten Sohn.
John nimmt seinen Enkelsohn Tate mit in das Sommercamp und hilft ihm, sich von seinem Trauma zu erholen, während neue Investoren versuchen, an sein Land zu kommen.
Alle Duttons versuchen die neuen Situationen auf ihre Weise anzugehen. Jamie hat in seiner neuen Position unerwartete Probleme, Beth trifft sich mit Roarke - dem neuen Big Player im Tal und John kümmert sich weiter um Tate.
John gibt seinem Enkelsohn Tate einige Lebensweisheiten mit auf den Weg, während Jamie Kraft seines neuen Amtes einen Mitarbeiter durch ein falsches Alibi schützt und Jimmy sich verliebt.
Eine Biker-Gang wird zum Problem für Rip und seine Leute - Beth treibt den Kampf gegen Investoren auf die Spitze und John bittet die Gouverneurin Perry um Hilfe.
Evan Rusk liegt tot in einem New Yorker Hotelzimmer. Ein Fall für Carrie, Al und Jay. Nach langen Überlegungen und intensiver Spurensuche finden sie einfach keinen Hinweis auf den oder die Mörder.
Beim Festival die Napoli bricht der beliebte Boxer Johnny d'Amato zusammen und stirbt. Wie sich später herausstellt, wurde er mit seiner eigenen Kombination erschlagen.
Ein Sexskandal bringt General Claridge, den Vizedirektor der NSA, in Schwierigkeiten und dem schwächelnden Nachrichtensender WHN die ersehnten Zuschauerquoten.
Als Carrie einen ermordeten Beamten, als jemanden wiedererkennt, mit dem sie in einem Untergrund-Casino Poker gespielt hat, riskiert sie ihre Karriere.
Duke Callaghan liegt mit einer Schusswunde am Hinterkopf in derselben Wohnung, in der sein 3jähriger Sohn Stevie spielt. Doch nicht nur das, Stevie spielt auch noch mit C4 Sprengstoff.
Carrie muss hinter AI's Rücken ermitteln, nachdem AI zum Hauptverdächtigen in einem Mord an einem kürzlich entlassenen Bandenmitglied wird, welches er in das Gefängnis gebracht hatte.